32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0018 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  61.59 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  62.79 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  65.29 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  55.4 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  58.04 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  57.36 
 
 		 169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  58.02 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  50.36 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  61.54 
 
 		 323 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  53.91 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  48.95 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  48.57 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  48.57 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  51.15 
 
 		 156 aa  123  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  51.56 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  47.14 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  45.75 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  49.3 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  51.16 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  34.42 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  30.2 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  32.48 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  41.43 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  30.77 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  33.08 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  27.78 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  36.03 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  38.53 
 
 		 245 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  34.69 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.112292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0264  hypothetical protein  31.11 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>