16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2765 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 125 aa  240  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  42.06 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  33.08 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  35.56 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  31.86 
 
 		 146 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  29.51 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  29.6 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  27.42 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  30.23 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  29.55 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  28.81 
 
 		 154 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  31.06 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  27.82 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  39.08 
 
 		 155 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  39.08 
 
 		 155 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>