30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3201 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  61.7 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  61.7 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  63.78 
 
 		 153 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  58.02 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  60.66 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  60.16 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  58.82 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  62.99 
 
 		 323 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  48.97 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  48.55 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  50.75 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  47.14 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  46.88 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  45.74 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  44.96 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  44.96 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  43.38 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  48.06 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  36.88 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  35.77 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  32.03 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  32.5 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  38.1 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  35.77 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  38.33 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  35.26 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4102  hypothetical protein  30.7 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.112292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>