More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1286 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  100 
 
 		 135 aa  280  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  92.59 
 
 		 135 aa  264  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  63.28 
 
 		 138 aa  180  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  56.83 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  58.45 
 
 		 153 aa  167  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  57.24 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  59.52 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  58.87 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  54.35 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  52.27 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  50.4 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  48.41 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  44.09 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  42.64 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  44.44 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  44.7 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  41.86 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  41.86 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  44.09 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  48.8 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  41.86 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  41.86 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  40.31 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  45.45 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  44.19 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  42.62 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  46.96 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  46.61 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  46.36 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  38.99 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  37.82 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  39.87 
 
 		 172 aa  90.5  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  36.13 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  35.58 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  33.77 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  31.37 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  32.89 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.12 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  34.06 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  33.77 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  33.13 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  34.84 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  42.52 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  31.14 
 
 		 177 aa  72  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  32.68 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  34.81 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  32.5 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.94 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  34.97 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  37.76 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  37.76 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  37.11 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  37.11 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  46.15 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  36.42 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.05 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  34.62 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  34.59 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32.58 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  35.05 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  38 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  30.63 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  34 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  37.76 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.01 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  33.66 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  30.94 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  35.64 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.61 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  33.66 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  34.31 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.58 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.01 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  30.7 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  36 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  31.73 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  31.73 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  31.73 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.9 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  31.73 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  31.73 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  40 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  32.93 
 
 		 164 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>