More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2724 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
331 aa  693    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  43.69 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  38.87 
 
 
330 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  40.62 
 
 
336 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  38.23 
 
 
337 aa  225  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  39.08 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  39.04 
 
 
335 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  38.39 
 
 
332 aa  218  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  38.14 
 
 
330 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  36.75 
 
 
325 aa  205  9e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  37.82 
 
 
343 aa  202  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  37.95 
 
 
328 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.01 
 
 
338 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  38.54 
 
 
344 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  37.12 
 
 
324 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  35.88 
 
 
388 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  38.12 
 
 
328 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  37.2 
 
 
329 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.14 
 
 
328 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.14 
 
 
328 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  35.56 
 
 
328 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  38.72 
 
 
328 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  37 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  36.17 
 
 
328 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  35.87 
 
 
328 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  37.23 
 
 
326 aa  178  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  35.49 
 
 
327 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  35.07 
 
 
667 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  34.12 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  32.44 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  32.44 
 
 
342 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  34.77 
 
 
337 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  37.6 
 
 
332 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 
327 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  32.25 
 
 
667 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 
322 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  37.5 
 
 
320 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  29.24 
 
 
458 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  32.02 
 
 
328 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  32.89 
 
 
374 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
667 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
468 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  31.09 
 
 
667 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
432 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 
435 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  33.72 
 
 
336 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 
435 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
435 aa  140  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  29.75 
 
 
345 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  35.48 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
356 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
384 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
384 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  32.56 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  33.46 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  39.68 
 
 
408 aa  135  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  28.28 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  34.8 
 
 
329 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  35.16 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  33.99 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.7 
 
 
384 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  26.36 
 
 
365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  35.18 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  35.18 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
433 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
372 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  27.79 
 
 
359 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
329 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 
320 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 
333 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0871  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0958984  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 
385 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32 
 
 
333 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
336 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  28.53 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  30.63 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  31.64 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2277  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.63 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  25.08 
 
 
340 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.1 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  28.48 
 
 
334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
346 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.6 
 
 
333 aa  116  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1312  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 
331 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  27.57 
 
 
374 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 
336 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>