210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2721 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
403 aa  838    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 
397 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.92 
 
 
389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.94 
 
 
399 aa  193  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 
405 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.66 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  32.98 
 
 
354 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  31.91 
 
 
403 aa  142  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  28.57 
 
 
419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  36.28 
 
 
403 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  31.39 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.53 
 
 
359 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.78 
 
 
360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  29.37 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.62 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  27.74 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.72 
 
 
359 aa  130  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.84 
 
 
359 aa  130  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.25 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  31.83 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  28.98 
 
 
351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.61 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  30.39 
 
 
360 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  27.42 
 
 
352 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  34.2 
 
 
353 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  29.15 
 
 
341 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  32.9 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 
351 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  29.84 
 
 
350 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.46 
 
 
423 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  28.18 
 
 
342 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  30.9 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  31.27 
 
 
347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  26.89 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  30.21 
 
 
342 aa  114  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  30.22 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  25.14 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  27.37 
 
 
353 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  28.27 
 
 
348 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  30.94 
 
 
418 aa  107  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  27.57 
 
 
334 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.57 
 
 
349 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  27.73 
 
 
459 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  26.15 
 
 
379 aa  94  5e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.57 
 
 
334 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  25.69 
 
 
355 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  23.88 
 
 
356 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  26.32 
 
 
351 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  24.73 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  26.2 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  27.37 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  27.75 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  27.31 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  25.44 
 
 
349 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30.05 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  26.97 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  25.65 
 
 
321 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  27.04 
 
 
321 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  28.37 
 
 
369 aa  63.2  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 
361 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  29.37 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  22.88 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  29.68 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  26.09 
 
 
355 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  23.73 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  31.13 
 
 
359 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  27.31 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  28.28 
 
 
366 aa  56.2  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  24.58 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  26.95 
 
 
368 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0854  3-dehydroquinate synthase  24.44 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00901382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  23.31 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  28.82 
 
 
373 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  27.2 
 
 
359 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  28.64 
 
 
388 aa  53.9  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  26.8 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  25.99 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  26.42 
 
 
350 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  28.46 
 
 
359 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  28.44 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  23.31 
 
 
362 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  23.31 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  23.31 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  23.31 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  23.31 
 
 
362 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  33.33 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  26.38 
 
 
363 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  27.78 
 
 
358 aa  53.1  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  26.8 
 
 
359 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  29.61 
 
 
365 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0087  3-dehydroquinate synthase  25 
 
 
345 aa  53.1  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  31.35 
 
 
357 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>