193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0891 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0891  type II secretory pathway pseudopilin PulG  100 
 
 
172 aa  345  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2553  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0896  hypothetical protein  31.88 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  45.45 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2558  hypothetical protein  59.22 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  40.58 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  31.48 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  60.61 
 
 
135 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  48.89 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  34.21 
 
 
114 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  30.56 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  33.91 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  40 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  49.12 
 
 
186 aa  47.8  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.5 
 
 
194 aa  47.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  40 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.96 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  46.15 
 
 
176 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  33.77 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  40.74 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  35.82 
 
 
140 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  44.44 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  41.18 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  48.89 
 
 
111 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  34.45 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  35.29 
 
 
121 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  28.85 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  41.51 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  37.11 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  42.25 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.22 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.38 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  30.4 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  30.4 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  52.38 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.38 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  35.38 
 
 
208 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  43.9 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1172  hypothetical protein  35.94 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  28.77 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2240  hypothetical protein  42.55 
 
 
123 aa  45.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  36.05 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.18 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.58 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  41.18 
 
 
157 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  38.46 
 
 
319 aa  44.3  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  35.96 
 
 
147 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  24.36 
 
 
134 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  53.49 
 
 
191 aa  44.3  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0677  lipoprotein ABC transporter permease  43.64 
 
 
137 aa  44.3  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  33.03 
 
 
163 aa  44.3  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  44.23 
 
 
144 aa  44.3  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  46.81 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  42.55 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.09 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0319  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.380813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  43.18 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3049  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.82 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1559  N-terminal methylation domain-containing protein  53.49 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.989333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0100  N-terminal methylation domain-containing protein  44.68 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.41 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  36.92 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  53.66 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  30.93 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  47.5 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  47.5 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  31.62 
 
 
150 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  27.87 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  32.05 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.07 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  34.04 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  32.05 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  33.03 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  43.86 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  30.58 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2094  hypothetical protein  36.36 
 
 
124 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.548773  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.82 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  31.18 
 
 
98 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1030  hypothetical protein  66.67 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.163763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  29.67 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  44.64 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  40.38 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.28 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  29.91 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  42.11 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  45.45 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  58.62 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  29.91 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  35.19 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.06 
 
 
163 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.61 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  29.91 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  33.78 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>