More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1069 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  79.91 
 
 		 214 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.84 
 
 		 214 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  80.37 
 
 		 214 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  79.91 
 
 		 214 aa  363  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  81.69 
 
 		 218 aa  362  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.32 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.39 
 
 		 247 aa  286  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.95 
 
 		 238 aa  278  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.68 
 
 		 235 aa  278  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.15 
 
 		 235 aa  277  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.27 
 
 		 221 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.63 
 
 		 227 aa  275  6e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 221 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 		 264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.75 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.74 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.74 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.79 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.72 
 
 		 231 aa  267  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.28 
 
 		 220 aa  267  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.1 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.03 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  60 
 
 		 221 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.62 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.1 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.48 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 		 223 aa  258  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 218 aa  256  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.1 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.55 
 
 		 216 aa  254  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 221 aa  254  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  58.77 
 
 		 220 aa  254  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.77 
 
 		 220 aa  254  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.5 
 
 		 221 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 232 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 223 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  56.94 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.92 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  57.48 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.03 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.92 
 
 		 217 aa  246  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  59.15 
 
 		 221 aa  246  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.81 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.26 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1309  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.763619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.61 
 
 		 217 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.05 
 
 		 222 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.28 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.79 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2371  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.79 
 
 		 227 aa  242  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.08 
 
 		 225 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.4 
 
 		 223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.16 
 
 		 219 aa  241  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  53.77 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.19 
 
 		 227 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2925  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.08 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  52.83 
 
 		 224 aa  241  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1509  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.24 
 
 		 218 aa  241  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.01 
 
 		 225 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.67 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.21 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.52 
 
 		 225 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.5 
 
 		 225 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  54.46 
 
 		 217 aa  238  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1024  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.47 
 
 		 225 aa  238  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.8 
 
 		 230 aa  238  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59 
 
 		 243 aa  237  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.29 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.65 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3466  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  52.51 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.826504 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0163  Ribulose-phosphate 3-epimerase  55.2 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.13 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.61 
 
 		 220 aa  235  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0722  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.29 
 
 		 227 aa  235  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.3 
 
 		 226 aa  235  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.7 
 
 		 227 aa  235  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  55.76 
 
 		 226 aa  236  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2620  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.08 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3999  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.11 
 
 		 224 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.79681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0626  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 		 225 aa  234  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  52.38 
 
 		 219 aa  234  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09980  Ribulose-phosphate 3-epimerase  52.11 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0307  Ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.02 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.24 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>