More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2664 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 1496 aa  2986    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  41.81 
 
 		 1070 aa  825    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  43.11 
 
 		 1071 aa  852    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  41.48 
 
 		 1067 aa  758    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  42.51 
 
 		 1069 aa  809    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  87.11 
 
 		 1041 aa  1807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  39.19 
 
 		 1028 aa  648    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  42.01 
 
 		 1054 aa  760    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  36.54 
 
 		 1062 aa  647    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.77 
 
 		 1050 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  42.21 
 
 		 1054 aa  752    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  41.9 
 
 		 1066 aa  785    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  65.61 
 
 		 1470 aa  1934    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  40.69 
 
 		 1095 aa  824    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  39.59 
 
 		 1028 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  42.01 
 
 		 1054 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  75.56 
 
 		 1036 aa  1587    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  42.56 
 
 		 1038 aa  767    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  41.98 
 
 		 1065 aa  810    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  42.66 
 
 		 1075 aa  814    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  42.19 
 
 		 1055 aa  729    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  58.81 
 
 		 1039 aa  1186    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  39.22 
 
 		 1028 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  42.91 
 
 		 1033 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  80.56 
 
 		 1032 aa  1722    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 		 1034 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  36.6 
 
 		 1035 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 		 1036 aa  605  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  36.55 
 
 		 1047 aa  602  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  38.24 
 
 		 1028 aa  602  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  68.45 
 
 		 460 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1044 aa  596  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  35.7 
 
 		 1033 aa  592  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  35.7 
 
 		 1033 aa  592  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1044 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  35.92 
 
 		 1031 aa  588  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  35.33 
 
 		 1044 aa  588  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  35.92 
 
 		 1031 aa  588  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  35.47 
 
 		 1405 aa  582  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1031 aa  582  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1058 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1073 aa  580  1e-164  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  71.16 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  33.82 
 
 		 1028 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1034 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  38.46 
 
 		 1045 aa  576  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1011 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  34.4 
 
 		 1022 aa  572  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  38.2 
 
 		 1038 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  34.85 
 
 		 1026 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1053 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1035 aa  566  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 		 1043 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  35.13 
 
 		 1101 aa  560  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  38.17 
 
 		 1044 aa  562  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1027 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  34.13 
 
 		 1042 aa  559  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  33.84 
 
 		 1177 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 		 1029 aa  556  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1031 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1032 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  33.06 
 
 		 1171 aa  548  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.24 
 
 		 1050 aa  547  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 		 1044 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1025 aa  550  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1033 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1048 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1042 aa  543  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1029 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  32.68 
 
 		 1088 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1088 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.4 
 
 		 1036 aa  538  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 		 1058 aa  539  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1041 aa  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.54 
 
 		 1032 aa  536  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1050 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1040 aa  536  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1042 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1032 aa  536  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1009 aa  533  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 		 1018 aa  536  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1041 aa  535  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1041 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1037 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1039 aa  533  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1027 aa  532  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  34.28 
 
 		 1044 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1088 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.91 
 
 		 1024 aa  530  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1027 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1059 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1050 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1103 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1048 aa  527  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1063 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1043 aa  525  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1043 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1058 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1048 aa  526  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1064 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>