More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1072 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  87.11 
 
 		 255 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  72.66 
 
 		 254 aa  377  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 258 aa  308  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  54.69 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1371  transcriptional regulator, IclR family  49.81 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000320522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2842  transcriptional regulator, IclR family  49.61 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.50092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  35.41 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  35.41 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  35.8 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  35.27 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 265 aa  158  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  30.98 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.79 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.96 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  34.54 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  33.88 
 
 		 251 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 		 302 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.48 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 308 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.74 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  27.63 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1115  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  30.22 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02910  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.64 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  26.8 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 550 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.13 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.29 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.86 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  28.4 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.35 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.35 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.35 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.35 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.35 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>