218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3844 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  94.78 
 
 		 230 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  70 
 
 		 229 aa  318  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  65.93 
 
 		 226 aa  299  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  63.84 
 
 		 225 aa  298  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  64.38 
 
 		 224 aa  294  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  61.88 
 
 		 221 aa  275  5e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  48.05 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  43.5 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  39.57 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  37.5 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3156  flagellar basal body L-ring protein  39.04 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  40.31 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  39.82 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  38.27 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2407  flagellar basal body L-ring protein  37.34 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  39.41 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  39.09 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  38.61 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  39.11 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  38.24 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  38.62 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  38.3 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  36.79 
 
 		 252 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  37.76 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  36.28 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  37.23 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  37.23 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  35.53 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  34.68 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  34.96 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  37.76 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  38.5 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000734  flagellar L-ring protein FlgH  36.77 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  38.33 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  36.09 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  37.44 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  36.09 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  38.92 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4193  flagellar L-ring protein  37.84 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  38.92 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  39.25 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2985  flagellar basal body L-ring protein  39.25 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  34.06 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  38.92 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4677  flagellar basal body L-ring protein  33.77 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039617 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  35.1 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04915  flagellar basal body L-ring protein  34.75 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  35.75 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  37.13 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  35.84 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3708  flagellar L-ring protein  34.33 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.388309 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4785  flagellar L-ring protein  34.33 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  35.16 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  35.9 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  33.18 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  35.84 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3094  flagellar basal body L-ring protein  40.98 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  32.3 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3462  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5631  flagellar basal body L-ring protein  35.47 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  36.65 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0348  flagellar L-ring protein precursor  33.91 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417331  normal  0.464223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  37.33 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  31.93 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  37.1 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  33.94 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2918  flagellar L-ring protein  33.19 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  37.73 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  38.21 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0212  flagellar basal body L-ring protein  36.96 
 
 		 220 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.144203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  31.86 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  37.67 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3645  flagellar basal body L-ring protein  34.74 
 
 		 219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.651179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  39.18 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0814  flagellar basal body L-ring protein  32.63 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0221  flagellar basal body L-ring protein  34.88 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3965  flagellar basal body L-ring protein  32.42 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  34.01 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0645  flagellar basal body L-ring protein  34.88 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  34.25 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0063  flagellar basal body L-ring protein  34.56 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2372  flagellar L-ring protein  33.33 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0031  flagellar L-ring protein  34.73 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2117  flagellar basal body L-ring protein  37.17 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.871595  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  36.77 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  30.53 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3740  flagellar basal body L-ring protein  34.47 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.736999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0625  flagellar L-ring protein  36.7 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.317328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0636  flagellar L-ring protein  36.51 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  35.71 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  33.03 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  36.36 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  34.39 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  32.57 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  38.83 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  37.97 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>