More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6797 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 733 aa  1421    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  56.22 
 
 		 717 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  49.12 
 
 		 766 aa  628  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  45.86 
 
 		 740 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  49.47 
 
 		 1308 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  46.65 
 
 		 805 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  45.95 
 
 		 731 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  44.09 
 
 		 710 aa  537  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  44.96 
 
 		 738 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10730  predicted RND superfamily drug exporter  44.03 
 
 		 762 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.896708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  41.63 
 
 		 770 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  43.11 
 
 		 783 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  40.55 
 
 		 796 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  40.34 
 
 		 736 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  38.82 
 
 		 751 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  38.71 
 
 		 758 aa  432  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.14 
 
 		 740 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  39.54 
 
 		 738 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  37.92 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  37.92 
 
 		 769 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  40.58 
 
 		 727 aa  429  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 1155 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  38.81 
 
 		 741 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  39.97 
 
 		 743 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.48 
 
 		 724 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  40.85 
 
 		 839 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  38.27 
 
 		 773 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.7 
 
 		 1095 aa  399  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  35.08 
 
 		 1013 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  35.22 
 
 		 944 aa  389  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  37.32 
 
 		 738 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  38.42 
 
 		 748 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  36.04 
 
 		 741 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  38.42 
 
 		 754 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  37.39 
 
 		 778 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  38.37 
 
 		 767 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  38.37 
 
 		 767 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  38.32 
 
 		 767 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  37.65 
 
 		 953 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.27 
 
 		 738 aa  363  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  38.92 
 
 		 761 aa  359  8e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  36.96 
 
 		 731 aa  340  8e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.85 
 
 		 997 aa  332  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  39.67 
 
 		 757 aa  316  9e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  36.39 
 
 		 743 aa  308  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  28.07 
 
 		 730 aa  296  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  28.3 
 
 		 730 aa  295  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  28.36 
 
 		 730 aa  293  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.17 
 
 		 730 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.17 
 
 		 730 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  28.44 
 
 		 730 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.17 
 
 		 730 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  28.03 
 
 		 730 aa  293  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  28.63 
 
 		 730 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  38.25 
 
 		 740 aa  290  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  32.04 
 
 		 743 aa  290  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  28.03 
 
 		 730 aa  287  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  32.57 
 
 		 737 aa  286  9e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.85 
 
 		 729 aa  282  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  33.43 
 
 		 741 aa  279  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  33.09 
 
 		 979 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  32.61 
 
 		 983 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  32.61 
 
 		 983 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  36.08 
 
 		 709 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.25 
 
 		 735 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2652  MMPL domain protein  34.85 
 
 		 751 aa  266  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  31.23 
 
 		 760 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  32.55 
 
 		 717 aa  264  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 		 846 aa  264  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  31.83 
 
 		 978 aa  264  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  31.09 
 
 		 752 aa  262  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  31.51 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  31.52 
 
 		 632 aa  261  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  34.78 
 
 		 966 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.83 
 
 		 745 aa  256  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  35.15 
 
 		 842 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  38.54 
 
 		 500 aa  253  7e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1195  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  38.05 
 
 		 743 aa  252  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490179  hitchhiker  0.0010558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  31.85 
 
 		 781 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  34.52 
 
 		 758 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  33.66 
 
 		 726 aa  247  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  32.24 
 
 		 749 aa  247  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  29.33 
 
 		 829 aa  246  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  29.33 
 
 		 829 aa  246  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  35.86 
 
 		 968 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  31.8 
 
 		 723 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  32.83 
 
 		 832 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  30.71 
 
 		 920 aa  242  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  38.16 
 
 		 814 aa  241  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.06 
 
 		 729 aa  240  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.49 
 
 		 714 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.67 
 
 		 796 aa  239  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.14 
 
 		 732 aa  239  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.33 
 
 		 917 aa  239  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.39 
 
 		 740 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  31.93 
 
 		 734 aa  234  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  32.12 
 
 		 731 aa  234  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.26 
 
 		 724 aa  232  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  33.61 
 
 		 761 aa  231  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  35.08 
 
 		 750 aa  231  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>