110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4377 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 319 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  74.01 
 
 		 327 aa  441  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  76.9 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  70.41 
 
 		 318 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  61.39 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  72.95 
 
 		 323 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  65.4 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  64.16 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  61.46 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  50.17 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.78 
 
 		 308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.69 
 
 		 303 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.58 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.69 
 
 		 304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.66 
 
 		 311 aa  212  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.12 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.71 
 
 		 250 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.07 
 
 		 236 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.55 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.97 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  33.46 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.92 
 
 		 245 aa  97.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  28.12 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  28.12 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.12 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 256 aa  96.3  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.13 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.79 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.53 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.58 
 
 		 233 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.97 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.83 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.8 
 
 		 282 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.07 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.07 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.68 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.42 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.25 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.58 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  29.52 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  29.19 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.68 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.25 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  32.69 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  33.71 
 
 		 343 aa  52.4  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  26.63 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.29 
 
 		 190 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.53 
 
 		 191 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.65 
 
 		 216 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.58 
 
 		 247 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.19 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  33.68 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  31.58 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  32.79 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  38.03 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  34.67 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  39.47 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.31 
 
 		 242 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  38.03 
 
 		 290 aa  46.2  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  34.67 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  35.23 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  31.73 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  25.7 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.45 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  24.42 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  40 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  35.29 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.67 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4890  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.87 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  38.16 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.82 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  41.33 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.76 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  35.23 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  41.33 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  38.03 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  34.52 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  35.29 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  32.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3579  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.04 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195352  normal  0.218152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  32.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  32.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  35.29 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  35.29 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  32.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  32.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4059  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.04 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  35.29 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.33 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  31.08 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  32.32 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>