More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4194 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1620  LuxR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4025  LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  37.92 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.27 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  37.27 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  37.27 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  35.85 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  33.82 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  33.58 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 156 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  60.66 
 
 		 781 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  45.79 
 
 		 917 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.88 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  44.76 
 
 		 209 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.43 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1438  response regulator receiver  45.68 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.494689  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.72 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  52.46 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1936  response regulator receiver protein  55.74 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  48.72 
 
 		 947 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.39 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.67 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  47.89 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  52.46 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.7 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.21 
 
 		 901 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  52.05 
 
 		 900 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.22 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.46 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.94 
 
 		 913 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.78 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.35 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 904 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.46 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  34.76 
 
 		 1006 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 967 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  54.1 
 
 		 894 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3231  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.229823  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 204 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  50.82 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.46 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0717  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.854815  normal  0.189113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  39.77 
 
 		 1019 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.24 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.46 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  43.96 
 
 		 914 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1600  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  44.05 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  44.93 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1953  two component LuxR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>