180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3804 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3804  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 820 aa  1553    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3833  transglutaminase domain protein  29.93 
 
 		 790 aa  191  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0481829  normal  0.0321175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2914  transglutaminase domain-containing protein  29.78 
 
 		 769 aa  183  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3114  transglutaminase domain-containing protein  29.8 
 
 		 784 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.0170569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  35.06 
 
 		 762 aa  157  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1290  transglutaminase domain-containing protein  27.29 
 
 		 866 aa  148  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1334  transglutaminase domain protein  25.07 
 
 		 859 aa  137  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000357459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1403  transglutaminase-like  33.89 
 
 		 850 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00325186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5778  transglutaminase domain protein  33.85 
 
 		 815 aa  131  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2422  transglutaminase domain protein  30.14 
 
 		 725 aa  127  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0450779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5110  transglutaminase domain-containing protein  28.75 
 
 		 825 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167034  normal  0.118743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2858  Transglutaminase-like protein protein-like protein  30.14 
 
 		 812 aa  125  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775139  normal  0.338432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3211  transglutaminase domain protein  30.13 
 
 		 763 aa  124  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452597  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1278  transglutaminase domain protein  28.85 
 
 		 846 aa  118  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000235429 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1584  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 790 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1208  transglutaminase domain-containing protein  29.62 
 
 		 831 aa  115  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4558  transglutaminase domain-containing protein  27.39 
 
 		 790 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4247  transglutaminase domain-containing protein  27.16 
 
 		 803 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  29.13 
 
 		 810 aa  111  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0884  transglutaminase domain protein  32.72 
 
 		 800 aa  110  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3075  transglutaminase domain-containing protein  31.17 
 
 		 798 aa  108  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104196  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1272  transglutaminase domain protein  30.18 
 
 		 771 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1395  transglutaminase domain-containing protein  33.49 
 
 		 782 aa  104  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305415  normal  0.0100536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05650  Na+-driven multidrug efflux pump  29.55 
 
 		 808 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  33.19 
 
 		 792 aa  99.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1098  transglutaminase-like  27.21 
 
 		 788 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  35.44 
 
 		 681 aa  95.5  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0930  transglutaminase domain-containing protein  29.96 
 
 		 730 aa  95.1  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  28.87 
 
 		 827 aa  94.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4815  transglutaminase domain protein  29.72 
 
 		 775 aa  93.6  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1151  transglutaminase domain protein  30.4 
 
 		 764 aa  91.3  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.301395  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1181  transglutaminase-like protein  39.86 
 
 		 760 aa  91.3  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.160419  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  34.44 
 
 		 736 aa  90.9  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1078  transglutaminase domain protein  30.27 
 
 		 862 aa  90.5  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3579  transglutaminase domain protein  28.02 
 
 		 774 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1056  transglutaminase-like protein  32.42 
 
 		 890 aa  90.5  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  21.39 
 
 		 742 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  29.02 
 
 		 742 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2773  transglutaminase-like protein  30.47 
 
 		 749 aa  89.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.663199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1333  transglutaminase domain protein  26.77 
 
 		 762 aa  90.1  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  26.28 
 
 		 728 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  28.02 
 
 		 822 aa  89  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  32.22 
 
 		 720 aa  88.6  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16680  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  32.03 
 
 		 783 aa  87  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.738671  normal  0.0217109 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  27.66 
 
 		 742 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 743 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  25.84 
 
 		 744 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  27.41 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5534  transglutaminase domain protein  29.78 
 
 		 753 aa  85.1  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0283272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3234  transglutaminase domain-containing protein  27.59 
 
 		 818 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00597045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  23.35 
 
 		 742 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  28.69 
 
 		 677 aa  85.1  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  36.36 
 
 		 806 aa  84.7  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  27.23 
 
 		 742 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  27.23 
 
 		 742 aa  84  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  27.23 
 
 		 742 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1762  transglutaminase domain protein  25.05 
 
 		 754 aa  84  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1588  transglutaminase domain protein  28.02 
 
 		 840 aa  82.8  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21580  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.73 
 
 		 844 aa  83.2  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.881874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3364  transglutaminase domain-containing protein  32.85 
 
 		 795 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0960  transglutaminase-like cysteine protease  26.52 
 
 		 837 aa  82.8  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3148  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  24.81 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8517  transglutaminase domain protein  26.4 
 
 		 788 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0481033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0487  transglutaminase domain protein  25.75 
 
 		 848 aa  79  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  26.94 
 
 		 742 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2424  transglutaminase domain-containing protein  35 
 
 		 639 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000343547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2052  hypothetical protein  35.67 
 
 		 634 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0986507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27440  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.4 
 
 		 859 aa  76.6  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  22.81 
 
 		 794 aa  75.5  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2962  transglutaminase domain protein  29.56 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0859741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2195  transglutaminase domain protein  26.35 
 
 		 790 aa  75.1  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330551  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0413  transglutaminase domain-containing protein  30.9 
 
 		 507 aa  74.3  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.939018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1321  transglutaminase domain protein  28.83 
 
 		 632 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0440  transglutaminase domain protein  22.7 
 
 		 748 aa  73.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  27.41 
 
 		 730 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0773  transglutaminase domain protein  31.61 
 
 		 790 aa  73.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  27.5 
 
 		 689 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1697  hypothetical protein  29.13 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1095  transglutaminase domain protein  25.82 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  28.06 
 
 		 748 aa  71.6  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0964  transglutaminase domain-containing protein  28.88 
 
 		 800 aa  71.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.490195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  27.01 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_003296  RS03011  hypothetical protein  28.83 
 
 		 681 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1649  transglutaminase domain protein  28.03 
 
 		 914 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.987605 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0189  transglutaminase domain-containing protein  28.03 
 
 		 763 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  30.83 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  29.63 
 
 		 706 aa  67.4  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2067  hypothetical protein  24.25 
 
 		 683 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.312074  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1943  transglutaminase-like  25.09 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.444996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1683  transglutaminase domain protein  33.14 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1077  transglutaminase domain protein  26.13 
 
 		 770 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2350  transglutaminase-like protein  25 
 
 		 730 aa  65.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3856  transglutaminase domain protein  29.12 
 
 		 674 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3970  transglutaminase domain protein  29.12 
 
 		 674 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0817675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2776  putative protease  24 
 
 		 754 aa  65.1  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.60504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0581  transglutaminase-like domain-containing protein  43.21 
 
 		 1238 aa  64.3  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  28.36 
 
 		 676 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0245  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 		 826 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.894287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0315  transglutaminase domain-containing protein  29.55 
 
 		 815 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072892  normal  0.0490481 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>