167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1761 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1761  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396883  hitchhiker  0.00317212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3150  hypothetical protein  75.42 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1031  putative periplasmic substrate-binding protein  66.67 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.377319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3557  putative periplasmic substrate-binding protein  65.13 
 
 		 255 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00679911  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2040  hypothetical protein  60.76 
 
 		 241 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0010  putative periplasmic substrate-binding protein  59.67 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2810  hypothetical protein  60 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2103  hypothetical protein  61.28 
 
 		 243 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000719716  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2246  hypothetical protein  60.85 
 
 		 240 aa  238  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155088  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07340  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  54.66 
 
 		 263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2226  periplasmic binding protein  55.02 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4823  periplasmic binding protein  53.81 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0893  putative periplasmic substrate-binding protein  58.97 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  43.35 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2532  periplasmic binding protein  40.65 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.870757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2937  periplasmic binding protein  40.94 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000364974  hitchhiker  0.00655173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0112  periplasmic binding protein  41.18 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.195536 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3091  periplasmic binding protein  42.8 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4706  periplasmic binding protein  35.48 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2323  periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3084  periplasmic binding protein  32.37 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3666  periplasmic binding protein  31.56 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.035512 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  30.08 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1134  periplasmic binding protein  32.76 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0216627  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0726  periplasmic binding protein  36.17 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0828  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0469  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0184  periplasmic binding protein  32.65 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4249  iron ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.06 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231782 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0131  hypothetical protein  32.95 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.881561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0283  hypothetical protein  30.08 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0141  hypothetical protein  28.74 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0133  hypothetical protein  28.35 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.76466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0100  hypothetical protein  31.47 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2820  periplasmic binding protein  29.59 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00857628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3733  periplasmic binding protein  29.73 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  30.6 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.67 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  22.71 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.1 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  27.37 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  27.37 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  22.4 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2792  periplasmic binding protein  33.85 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1388  iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  24.63 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.783574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  31.95 
 
 		 310 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.95 
 
 		 310 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.95 
 
 		 310 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  31.95 
 
 		 310 aa  62  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  29.61 
 
 		 332 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  29.61 
 
 		 310 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  29.61 
 
 		 310 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  32.4 
 
 		 289 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  32.4 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.34 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  22.46 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.32 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  29.07 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  32.26 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.95 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1017  periplasmic binding protein  22.28 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1005  periplasmic binding protein  22.28 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  32.09 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  21.24 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3358  periplasmic binding protein  22.28 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2808  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0983  periplasmic binding protein  22.28 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.24 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.74 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.04 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  32.64 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.37 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  31.63 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  20.73 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  32.8 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  20.73 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  35.4 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  28.4 
 
 		 339 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  40.13 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  32.8 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5781  ABC Fe3+siderophore/cobalamin transporter, periplasmic ligand binding protein  32.24 
 
 		 304 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.403027 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>