More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1609 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000418477  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
267 aa  268  8.999999999999999e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.29 
 
 
256 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.186116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
255 aa  228  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.218864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
265 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
277 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
257 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
275 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
253 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
253 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  36.9 
 
 
253 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
254 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
253 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
256 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1939  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
266 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337839  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
252 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
253 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
256 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
250 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
253 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
252 aa  148  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
278 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0664091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
246 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
251 aa  145  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
251 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  36 
 
 
248 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
246 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
251 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000225653  hitchhiker  0.0000000041248 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
269 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
257 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
250 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
251 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.18 
 
 
246 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
249 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  37.3 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.18 
 
 
246 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  35.2 
 
 
256 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
251 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 
252 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.71 
 
 
249 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
249 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
251 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
254 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
253 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
248 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 
255 aa  135  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
266 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
245 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
252 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.75 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.06 
 
 
302 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
255 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
250 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.55 
 
 
246 aa  133  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
253 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0642  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.29 
 
 
274 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133584  normal  0.0990143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
253 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  34.52 
 
 
255 aa  132  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.35 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 
253 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
270 aa  131  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.06 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.68 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  31.98 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>