More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2579 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  495  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  65.45 
 
 
248 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  61.13 
 
 
254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  61.54 
 
 
253 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  60.32 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  60.32 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  60.32 
 
 
253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
245 aa  263  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3280  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 
257 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0870  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 
262 aa  175  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.13 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.13 
 
 
246 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
247 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
261 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.458297  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
253 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
256 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
255 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
251 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
244 aa  151  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
255 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  43.75 
 
 
252 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
248 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
255 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  39.68 
 
 
255 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
247 aa  148  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0721  2-hydroxycyclohexanecarboxyl-CoA dehydrogenase  40.64 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
256 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
252 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
258 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.4 
 
 
255 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
253 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.96 
 
 
246 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 
258 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
256 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
251 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
256 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
249 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
246 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
245 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
255 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
244 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
253 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
254 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1580  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  39.29 
 
 
255 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
255 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  40 
 
 
247 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
253 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000418477  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1827  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  39.29 
 
 
255 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.94 
 
 
252 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
251 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
268 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01588  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.89 
 
 
255 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
255 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.444586  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
267 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
246 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.52 
 
 
252 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01578  hypothetical protein  38.89 
 
 
255 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1806  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.89 
 
 
255 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2331  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.89 
 
 
255 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2011  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.89 
 
 
255 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617976  normal  0.65251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.65 
 
 
249 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.54 
 
 
245 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1500  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 
256 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
252 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
252 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
252 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
252 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
252 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
252 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
252 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1694  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  38.89 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.04 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.41 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>