More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6456 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000225653  hitchhiker  0.0000000041248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1221  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.64 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  41.6 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  41.53 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 250 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  40.46 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1368  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.1 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.69 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  36.69 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.24 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 		 253 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 269 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 		 253 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.85 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.85 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.85 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.85 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.85 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.85 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>