More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2076 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2076  luciferase-like  100 
 
 		 396 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1971  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  64.99 
 
 		 416 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1469  luciferase-like  27.14 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  24.67 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0573  luciferase family protein  24.89 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1774  alkanal monooxygenase  26.68 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0539243  normal  0.0415142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  25.91 
 
 		 734 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  25 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0962  alkanal monooxygenase alpha chain  35.45 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.99674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  24.87 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  25.96 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.95 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2291  luciferase family protein  22.87 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06242  alkanal monooxygenase alpha chain  39.05 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0457  luciferase-like  38.54 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.710485  normal  0.228876 
 
 
-
 
NC_003296  RS03171  putative luciferase (monooxygenase) oxidoreductase protein  25.69 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  25.53 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  25.59 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  24.54 
 
 		 346 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3644  luciferase family protein  27.88 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.130748  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2278  luciferase  37.76 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0442763  normal  0.0103665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3405  luciferase-like protein  44.44 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  24.74 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2260  luciferase family protein  36.84 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2087  luciferase family protein  27.88 
 
 		 346 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147979  normal  0.63736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  28.65 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4178  Luciferase-like monooxygenase  32.06 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  25.71 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2265  luciferase family protein  26.06 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  31.01 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  31.98 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4460  luciferase-like protein  32.54 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0972  luciferase-like protein  31.78 
 
 		 342 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2588  bacterial luciferase family protein  35.71 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.143367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  25.98 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  25.64 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5586  Luciferase-like monooxygenase  35.05 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0885387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6547  Luciferase-like monooxygenase  35.05 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  24.8 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  22.59 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0732  luciferase  44.44 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0647  luciferase-like monooxygenase  44.44 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4322  luciferase family protein  41.38 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.29 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  23.62 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  24.86 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6252  luciferase family protein  33.33 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  0.361259 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  31.54 
 
 		 348 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5506  Luciferase-like monooxygenase  22.47 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000556535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  42.68 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3900  Luciferase-like, subgroup  29.7 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.310372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  25.53 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0087  Luciferase-like monooxygenase  36.73 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.33 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3263  luciferase-like  34.69 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.712407  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  35.79 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  26.47 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.65 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6122  luciferase family protein  36 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.632716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0953  putative luciferase-like monooxygenase  23.77 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1793  alkanal monooxygenase  37.86 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  24.29 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  24.11 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  25.67 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  31.28 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2881  luciferase-like protein  34.65 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4006  luciferase-like protein  35.58 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  25.19 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.84 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  31.9 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5502  Luciferase-like monooxygenase  33.58 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1444  luciferase family protein  25.82 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2522  luciferase-like monooxygenase  31.79 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0436016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4156  alkanal monooxygenase  33.04 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215497  normal  0.0257057 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7310  monooxygenase  38.1 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  29.34 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6087  alkanal monooxygenase alpha chain  31.31 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.518252  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  25.95 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  22.93 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2525  luciferase-like  37.93 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  22.56 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  26.75 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  24.74 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2108  luciferase family protein  26.82 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4241  luciferase family protein  29.45 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00842618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  26.69 
 
 		 3337 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  39.13 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2745  luciferase family protein  39.8 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.266873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2103  luciferase family protein  37 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0919949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1046  Luciferase-like monooxygenase  23.36 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.974969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  24.65 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3153  luciferase family protein  40.24 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  23.41 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  26.02 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  27.42 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2477  luciferase family protein  30.77 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8741  Luciferase-like monooxygenase  27.08 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0277  luciferase-alpha subunit  37.97 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.200385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2115  luciferase family protein  40.38 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.287313  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>