More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0815 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 230 aa  457  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  69.68 
 
 		 218 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 		 156 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  55.41 
 
 		 157 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  42.11 
 
 		 162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  43.42 
 
 		 175 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 169 aa  99.4  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 175 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 169 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 157 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  38.51 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  33.76 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  35.51 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  41.18 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 140 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  41.18 
 
 		 140 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 140 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  28.68 
 
 		 153 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 178 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  28.68 
 
 		 153 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  28.89 
 
 		 164 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  28.89 
 
 		 164 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  28.89 
 
 		 164 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 162 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 		 140 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 		 430 aa  52  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 140 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 		 169 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  45.1 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 166 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  45.1 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  34.67 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0519  NUDIX family hydrolase  30.16 
 
 		 168 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.259714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 146 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 130 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  45.1 
 
 		 160 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  41.94 
 
 		 181 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  26.57 
 
 		 153 aa  49.7  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 156 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 		 169 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 162 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 169 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 133 aa  49.3  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 156 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  42.37 
 
 		 158 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 166 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  40.38 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 186 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 140 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0381  ADP-ribose pyrophosphatase  35.06 
 
 		 164 aa  48.5  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.225605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 167 aa  48.5  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 153 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  39.71 
 
 		 148 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  39.71 
 
 		 148 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 155 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 177 aa  48.5  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 155 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 153 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 155 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  40.58 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  35.48 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  39.06 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  38.24 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  31.62 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 525 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 96 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>