More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1145 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  868    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  58.63 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  59.09 
 
 		 421 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 423 aa  295  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  36.28 
 
 		 488 aa  251  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  31 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  31 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32014  predicted protein  28.18 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 426 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44298  predicted protein  27.32 
 
 		 1736 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.43 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 440 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 426 aa  96.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 416 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 444 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 449 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 405 aa  86.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  24.48 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  24.68 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  24.37 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 397 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 465 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  32.92 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 392 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0707  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  21.87 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0743  major facilitator family transporter  28.24 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.23331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0801  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.26 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  25.52 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0898  major facilitator family transporter  22.88 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.15 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.67 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>