More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4270 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 343 aa  695    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  33.19 
 
 		 333 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  32.49 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.55 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  27.9 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2680  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  27.15 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  32.94 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  28.3 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  27.05 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 303 aa  97.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  36.69 
 
 		 310 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 325 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  24.13 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  27.86 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 313 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4364  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196876  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  30.63 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  28.93 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03650  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1207  transcriptional regulatory protein  31.54 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.654972  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  31.97 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  31.29 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  31.29 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  28.93 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0422  AraC family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  31.29 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  25.36 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  28.85 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2168  transcriptional regulator, AraC family  23.91 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  37.25 
 
 		 319 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1805  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3614  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  21.76 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  33.03 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  20 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  24.85 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3518  cyclic nucleotide-binding  42.11 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0658  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 234 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0392  helix-turn-helix domain-containing protein  33.08 
 
 		 316 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1428  helix-turn-helix domain-containing protein  25.18 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3322  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0422488  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 129 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  37.89 
 
 		 529 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.93 
 
 		 1347 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  28.57 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  28.57 
 
 		 1366 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  32.63 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  25.96 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  26.62 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>