232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2811 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1868  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  72.35 
 
 		 463 aa  713    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00525  putative arginine decarboxylase  78.4 
 
 		 486 aa  783    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2811  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 467 aa  957    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0595118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6223  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.13 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3427  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.78 
 
 		 501 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0150373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1576  arginine decarboxylase, biosynthetic  57.21 
 
 		 430 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584037  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5527  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.49 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.0601213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2320  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.28 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.389053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2839  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.63 
 
 		 522 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2474  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.38 
 
 		 528 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4514  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.68 
 
 		 576 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0113275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1778  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.91 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.513471  normal  0.693923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2606  arginine decarboxylase  26.4 
 
 		 635 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00461  arginine decarboxylase  26.35 
 
 		 648 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0983  arginine decarboxylase  25 
 
 		 635 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2537  arginine decarboxylase  24.93 
 
 		 635 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2916  arginine decarboxylase  24.93 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0904  arginine decarboxylase  25.08 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1675  arginine decarboxylase  25.55 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00247787  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00481  arginine decarboxylase  26.03 
 
 		 648 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0046  arginine decarboxylase  26.03 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00521  arginine decarboxylase  25.66 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1309  arginine decarboxylase  24.86 
 
 		 635 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000212107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2097  arginine decarboxylase  23.56 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  24.83 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28311  arginine decarboxylase  20.4 
 
 		 648 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1650  arginine decarboxylase  24.59 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0727  arginine decarboxylase  21.43 
 
 		 637 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.594395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2513  arginine decarboxylase  20.27 
 
 		 642 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1677  arginine decarboxylase  24.14 
 
 		 681 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.814883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1658  arginine decarboxylase  23.08 
 
 		 645 aa  75.5  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.944199  normal  0.0506092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1378  arginine decarboxylase  24.61 
 
 		 647 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2172  arginine decarboxylase  20.86 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00591  arginine decarboxylase  25.24 
 
 		 647 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0970534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3423  arginine decarboxylase  20.5 
 
 		 671 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1142  arginine decarboxylase  23.29 
 
 		 693 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.344888  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4381  arginine decarboxylase  21.45 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0627  arginine decarboxylase  21.6 
 
 		 637 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4038  arginine decarboxylase  23.44 
 
 		 679 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.781244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1846  arginine decarboxylase  21.2 
 
 		 669 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1132  arginine decarboxylase  26.44 
 
 		 609 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000828  biosynthetic arginine decarboxylase  20.55 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00030199  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00521  arginine decarboxylase  23.49 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.325981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0006  arginine decarboxylase  23.32 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0006  arginine decarboxylase  23.32 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1037  arginine decarboxylase  21.87 
 
 		 647 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.919876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4842  biosynthetic arginine decarboxylase  21.15 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.540433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1557  arginine decarboxylase  22.33 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1632  arginine decarboxylase  22.33 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.386766  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63990  arginine decarboxylase  20.87 
 
 		 636 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4598  arginine decarboxylase  21.23 
 
 		 637 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0659709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0567  arginine decarboxylase  21.23 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06737  arginine decarboxylase  20.55 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0606  arginine decarboxylase  21.23 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0520  arginine decarboxylase  33.83 
 
 		 637 aa  69.3  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.105448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0612  arginine decarboxylase  20.85 
 
 		 637 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1870  arginine decarboxylase  21.67 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  21.78 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1624  arginine decarboxylase  21.4 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0743651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3789  arginine decarboxylase  23.28 
 
 		 636 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  25.09 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1761  arginine decarboxylase  20.95 
 
 		 637 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0168893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2517  arginine decarboxylase  20.95 
 
 		 637 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.977379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1768  arginine decarboxylase  20.95 
 
 		 637 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1805  arginine decarboxylase  20.95 
 
 		 637 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0026532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3934  arginine decarboxylase  20.99 
 
 		 655 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.948508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0026  arginine decarboxylase  21.91 
 
 		 650 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  22.43 
 
 		 435 aa  67  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  22.32 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3466  arginine decarboxylase  21.8 
 
 		 645 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1698  arginine decarboxylase  31.78 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1536  arginine decarboxylase  21.56 
 
 		 643 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  24.55 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  24.55 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0550  arginine decarboxylase  21.4 
 
 		 657 aa  65.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5559  arginine decarboxylase  20.25 
 
 		 636 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1647  arginine decarboxylase  20.63 
 
 		 637 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0254  arginine decarboxylase  29.46 
 
 		 641 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164965  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0419  arginine decarboxylase  20.96 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00340731  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0895  arginine decarboxylase  29.33 
 
 		 613 aa  64.3  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.262836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2412  arginine decarboxylase  22 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0861  arginine decarboxylase  31.68 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.221481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2480  arginine decarboxylase  21.33 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1619  arginine decarboxylase  30.23 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000092888  normal  0.0751508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0202  arginine decarboxylase  32.35 
 
 		 634 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.500667  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03894  arginine decarboxylase  21.92 
 
 		 639 aa  63.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0027527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03648  arginine decarboxylase  20.7 
 
 		 628 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2840  arginine decarboxylase  23.36 
 
 		 634 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3124  arginine decarboxylase  20.07 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02768  arginine decarboxylase  21.33 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0756  arginine decarboxylase  21.33 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2057  arginine decarboxylase  31.01 
 
 		 637 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126213  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0773  arginine decarboxylase  21.33 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3281  arginine decarboxylase  21.33 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2609  arginine decarboxylase  31.01 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901624  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02731  hypothetical protein  21.33 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07050  arginine decarboxylase  18.46 
 
 		 636 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3096  arginine decarboxylase  21.33 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3371  arginine decarboxylase  21.33 
 
 		 658 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1119  arginine decarboxylase  21.55 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>