More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2537 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1309  arginine decarboxylase  82.05 
 
 		 635 aa  1109    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000212107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0983  arginine decarboxylase  90.71 
 
 		 635 aa  1192    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2537  arginine decarboxylase  100 
 
 		 635 aa  1304    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2097  arginine decarboxylase  79.65 
 
 		 636 aa  1087    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0904  arginine decarboxylase  96.69 
 
 		 635 aa  1267    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1675  arginine decarboxylase  85.2 
 
 		 635 aa  1150    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00247787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2606  arginine decarboxylase  81.89 
 
 		 635 aa  1107    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2916  arginine decarboxylase  82.05 
 
 		 635 aa  1108    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0026  arginine decarboxylase  45.67 
 
 		 650 aa  589  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3423  arginine decarboxylase  44.13 
 
 		 671 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4038  arginine decarboxylase  44.7 
 
 		 679 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.781244 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1846  arginine decarboxylase  43.74 
 
 		 669 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1677  arginine decarboxylase  43.77 
 
 		 681 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.814883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3934  arginine decarboxylase  43.96 
 
 		 655 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.948508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1650  arginine decarboxylase  43.84 
 
 		 681 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1037  arginine decarboxylase  42.2 
 
 		 647 aa  554  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.919876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2513  arginine decarboxylase  42.43 
 
 		 642 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2172  arginine decarboxylase  42.14 
 
 		 642 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00521  arginine decarboxylase  42.54 
 
 		 648 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1142  arginine decarboxylase  43.08 
 
 		 693 aa  541  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.344888  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1983  arginine decarboxylase  41.8 
 
 		 654 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2068  arginine decarboxylase  41.8 
 
 		 654 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28311  arginine decarboxylase  41.6 
 
 		 648 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1896  arginine decarboxylase  41.64 
 
 		 654 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.907046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1119  arginine decarboxylase  41.05 
 
 		 639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03894  arginine decarboxylase  40.92 
 
 		 639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0027527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1964  arginine decarboxylase  40.78 
 
 		 660 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1771  arginine decarboxylase  41.27 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00481  arginine decarboxylase  41.51 
 
 		 648 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00461  arginine decarboxylase  41.74 
 
 		 648 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1378  arginine decarboxylase  41.42 
 
 		 647 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2321  arginine decarboxylase  39.53 
 
 		 655 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00591  arginine decarboxylase  41.57 
 
 		 647 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0970534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0571  arginine decarboxylase  39.84 
 
 		 650 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00521  arginine decarboxylase  39.97 
 
 		 648 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.325981  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1658  arginine decarboxylase  42.02 
 
 		 645 aa  510  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.944199  normal  0.0506092 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0046  arginine decarboxylase  41.51 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2839  arginine decarboxylase  39.81 
 
 		 647 aa  502  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1536  arginine decarboxylase  39.06 
 
 		 645 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.767792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0901  arginine decarboxylase  39.34 
 
 		 638 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1870  arginine decarboxylase  40.22 
 
 		 637 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1598  arginine decarboxylase  40.95 
 
 		 639 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0503845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3873  arginine decarboxylase  38.86 
 
 		 642 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1557  arginine decarboxylase  40.22 
 
 		 637 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1632  arginine decarboxylase  40.22 
 
 		 637 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.386766  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1624  arginine decarboxylase  40.53 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0743651 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3114  arginine decarboxylase  39.65 
 
 		 630 aa  498  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.188561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3466  arginine decarboxylase  42.3 
 
 		 645 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3124  arginine decarboxylase  40.75 
 
 		 627 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1647  arginine decarboxylase  40.84 
 
 		 637 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1768  arginine decarboxylase  40.68 
 
 		 637 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2517  arginine decarboxylase  40.68 
 
 		 637 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.977379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1761  arginine decarboxylase  40.68 
 
 		 637 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1805  arginine decarboxylase  40.68 
 
 		 637 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0026532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1619  arginine decarboxylase  39.94 
 
 		 637 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000092888  normal  0.0751508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2517  arginine decarboxylase  37.81 
 
 		 639 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.332138  normal  0.039824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0557  arginine decarboxylase  40.16 
 
 		 629 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.321507  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0072  arginine decarboxylase  39.21 
 
 		 628 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2840  arginine decarboxylase  41.36 
 
 		 634 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2609  arginine decarboxylase  39.94 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901624  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1698  arginine decarboxylase  38.85 
 
 		 636 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1963  arginine decarboxylase  39.47 
 
 		 636 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2057  arginine decarboxylase  40.09 
 
 		 637 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126213  normal  0.137004 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1536  arginine decarboxylase  40.69 
 
 		 643 aa  481  1e-134  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2480  arginine decarboxylase  38.53 
 
 		 637 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.46516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2412  arginine decarboxylase  40.69 
 
 		 626 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0202  arginine decarboxylase  38.97 
 
 		 634 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.500667  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3789  arginine decarboxylase  39.83 
 
 		 636 aa  477  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06737  arginine decarboxylase  39.33 
 
 		 640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000828  biosynthetic arginine decarboxylase  39.01 
 
 		 640 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00030199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2280  arginine decarboxylase  37.93 
 
 		 636 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000837435  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0254  arginine decarboxylase  39.43 
 
 		 641 aa  463  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164965  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0419  arginine decarboxylase  38.52 
 
 		 661 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00340731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0612  arginine decarboxylase  37.97 
 
 		 637 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0544  arginine decarboxylase  38.8 
 
 		 633 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.073067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63990  arginine decarboxylase  38.99 
 
 		 636 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5559  arginine decarboxylase  38.83 
 
 		 636 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0567  arginine decarboxylase  37.97 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4842  biosynthetic arginine decarboxylase  37.97 
 
 		 637 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.540433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4381  arginine decarboxylase  37.91 
 
 		 637 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0627  arginine decarboxylase  37.97 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0606  arginine decarboxylase  37.82 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0727  arginine decarboxylase  37.56 
 
 		 637 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.594395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4598  arginine decarboxylase  37.82 
 
 		 637 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0659709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0520  arginine decarboxylase  39.57 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.105448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2047  arginine decarboxylase  38.62 
 
 		 625 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3344  arginine decarboxylase  38.03 
 
 		 658 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3768  arginine decarboxylase  38.53 
 
 		 629 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0508  arginine decarboxylase  38.15 
 
 		 658 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3903  arginine decarboxylase  37.79 
 
 		 659 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0317541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3973  arginine decarboxylase  38.51 
 
 		 658 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0845  arginine decarboxylase  37.72 
 
 		 659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3349  arginine decarboxylase  37.72 
 
 		 659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0843  arginine decarboxylase  37.72 
 
 		 659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3333  arginine decarboxylase  38.03 
 
 		 632 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0550  arginine decarboxylase  38.15 
 
 		 657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314322  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3325  arginine decarboxylase  38.03 
 
 		 632 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591958  normal  0.70504 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1471  arginine decarboxylase  39.4 
 
 		 637 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03648  arginine decarboxylase  38.07 
 
 		 628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1186  arginine decarboxylase  39.4 
 
 		 637 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.470045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>