77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3919 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  100 
 
 
341 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  84.16 
 
 
337 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  84.12 
 
 
337 aa  598  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  84.12 
 
 
337 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  84.12 
 
 
337 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  83.53 
 
 
337 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  83.53 
 
 
337 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  83.53 
 
 
337 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  83.53 
 
 
337 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  83.53 
 
 
337 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  86.26 
 
 
342 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  86.26 
 
 
342 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  86.26 
 
 
342 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  86.26 
 
 
342 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  85.96 
 
 
342 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  65.77 
 
 
339 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  70.66 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  69.4 
 
 
338 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  68.32 
 
 
366 aa  434  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  68.65 
 
 
361 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  67.55 
 
 
357 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  62.42 
 
 
332 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  65.69 
 
 
328 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  38.32 
 
 
361 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  37.41 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  35.83 
 
 
366 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  34.98 
 
 
346 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  32.82 
 
 
377 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  34.62 
 
 
339 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  34.62 
 
 
339 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  35.69 
 
 
343 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  35.38 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  32.4 
 
 
332 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  29.86 
 
 
341 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  33.21 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  32.5 
 
 
374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  33.66 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  31.21 
 
 
390 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  29.47 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  27.24 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  26.32 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  26.94 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  25.26 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  25 
 
 
307 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  22.99 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  22.95 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  21.84 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  22.74 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  24.56 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  21.72 
 
 
357 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  21.43 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  23.24 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  23.81 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  20.5 
 
 
360 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  26.28 
 
 
389 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  24.65 
 
 
546 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  26.84 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  23.57 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0702  ribonuclease BN  22.27 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  21.85 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  20.86 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01081  serum resistance locus BrkB-like protein  26.19 
 
 
313 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  24.6 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  28.11 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  25.95 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  25.95 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  25.95 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  25 
 
 
345 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  23.08 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  22.75 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  25.67 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01071  serum resistance locus BrkB-like protein  25 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  21.91 
 
 
331 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  22.83 
 
 
263 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  22.14 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0099  serum resistance locus BrkB-like protein  24.78 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0014  putative ribonuclease BN  23.27 
 
 
450 aa  42.4  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>