More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2308 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2308  response regulator of RpoS  100 
 
 		 337 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.863566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1880  response regulator of RpoS  87.24 
 
 		 337 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.239117  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1575  response regulator of RpoS  86.94 
 
 		 337 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.307447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1392  response regulator of RpoS  87.24 
 
 		 337 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1943  response regulator of RpoS  87.24 
 
 		 337 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.941531 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1886  response regulator of RpoS  87.24 
 
 		 337 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0489347  normal  0.205124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01211  response regulator of RpoS  86.65 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01221  hypothetical protein  86.65 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417729  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1906  response regulator of RpoS  86.65 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174648  normal  0.215745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1400  response regulator of RpoS  86.65 
 
 		 337 aa  584  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1720  response regulator of RpoS  86.65 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1384  response regulator of RpoS  86.65 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.421294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2392  response regulator of RpoS  86.65 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1343  response regulator of RpoS  86.65 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00109338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2710  response regulator of RpoS  69.73 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.317611  hitchhiker  0.000232648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1959  response regulator of RpoS  63.61 
 
 		 338 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2201  response regulator of RpoS  66.57 
 
 		 338 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2331  response regulator of RpoS  64.09 
 
 		 338 aa  441  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000591908  normal  0.501576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2078  response regulator of RpoS  64.09 
 
 		 338 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1969  response regulator of RpoS  63.8 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.313928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1979  response regulator of RpoS  63.91 
 
 		 338 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2280  response regulator of RpoS  63.91 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0568  response regulator  32.8 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002881  response regulator  29.39 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1082  response regulator  30.1 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03091  hypothetical protein  29.17 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1648  response regulator receiver protein  31.56 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0057956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  29.87 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2546  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  28.82 
 
 		 412 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  27.98 
 
 		 394 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  25.96 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  25.96 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 394 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1396  response regulator receiver protein  26.15 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00425013  normal  0.314583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  27.03 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.21 
 
 		 393 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 393 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  28.21 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  24.04 
 
 		 399 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.83 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3196  response regulator  26.77 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2806  response regulator receiver protein  25.53 
 
 		 373 aa  95.9  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1372  response regulator receiver protein  25.98 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0119088  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  26.29 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 410 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1356  response regulator receiver  26.21 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3465  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.6 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  39.42 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 544 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.37 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.59 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.95 
 
 		 900 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  37 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2612  two component transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0412974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.8 
 
 		 767 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.83 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  27.32 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1436 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 925 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  37.61 
 
 		 2301 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.83 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.854352 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1954  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.897911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.64 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3050  two component transcriptional regulator  34.09 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  37.62 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0123  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.35 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  42.57 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  40.59 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  37.61 
 
 		 2284 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  31.67 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4368  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0838  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 1184 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  35.58 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5811  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  35.58 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.18 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>