More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1392 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  56.83 
 
 		 211 aa  232  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 332 aa  62  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  32.5 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  32.79 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  33 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.61 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  45.61 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  29.83 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>