More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3321 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  100 
 
 		 326 aa  658    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  42.15 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  37.54 
 
 		 338 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  37.29 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  36.39 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  38.49 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  38.24 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  38.23 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  36.71 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  39.85 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  40.17 
 
 		 391 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  37.25 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  35.15 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  36.99 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  37.92 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  40 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  38.31 
 
 		 320 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  35.24 
 
 		 321 aa  178  9e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  39.08 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  39.08 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  34.55 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  35.35 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  37.7 
 
 		 322 aa  175  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  34.13 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  34.06 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  34.13 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  35.23 
 
 		 366 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  33.97 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  35.4 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  35.18 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  35.18 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  34.78 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  33.23 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  35.91 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  38.98 
 
 		 387 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  39.3 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  35.53 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  39.02 
 
 		 405 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  39.66 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  43.58 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.34 
 
 		 370 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  38.26 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  37.1 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  38.49 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  36.51 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  35.74 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  39.62 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  33.11 
 
 		 369 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.68 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  34.73 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  37.13 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  39.74 
 
 		 355 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.97 
 
 		 425 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  36.02 
 
 		 389 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 		 493 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  34.4 
 
 		 477 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  32.94 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  42.05 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  36.02 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  32.55 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  35.56 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.02 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  32.77 
 
 		 424 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  34.98 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  36.09 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  37.82 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  37.06 
 
 		 804 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  38.69 
 
 		 829 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  32.51 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  36.99 
 
 		 243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  38.14 
 
 		 810 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  37.56 
 
 		 814 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  38.24 
 
 		 685 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.64 
 
 		 759 aa  114  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  31.75 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  28.81 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  31.36 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.8 
 
 		 769 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  32.41 
 
 		 442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.2 
 
 		 630 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000142168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.43 
 
 		 662 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.27 
 
 		 768 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.53 
 
 		 718 aa  109  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.34 
 
 		 806 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.88 
 
 		 659 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  29.09 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  29.91 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  33.82 
 
 		 721 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.18 
 
 		 760 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.23 
 
 		 754 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  32.74 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.99 
 
 		 754 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  37.32 
 
 		 688 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>