More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5846 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  76.2 
 
 		 657 aa  1082    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  100 
 
 		 727 aa  1493    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.92 
 
 		 493 aa  88.6  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.1 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.5 
 
 		 401 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  22.88 
 
 		 880 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  23.8 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  26.64 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.14 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  22.51 
 
 		 880 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  22.51 
 
 		 880 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  22.51 
 
 		 880 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.3 
 
 		 14916 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  25.98 
 
 		 880 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  25.81 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  28.94 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  22.14 
 
 		 877 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 		 862 aa  73.9  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  25.74 
 
 		 332 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  31.3 
 
 		 1191 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 		 576 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  26.22 
 
 		 415 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  30.26 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  28.84 
 
 		 214 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  24.26 
 
 		 389 aa  70.1  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.18 
 
 		 348 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  26.64 
 
 		 267 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 		 872 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  24.15 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  26.47 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.76 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  31.82 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  29.3 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.76 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  30.14 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.02 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  29.71 
 
 		 215 aa  67.4  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  27.8 
 
 		 295 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.19 
 
 		 521 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  27.23 
 
 		 263 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.62 
 
 		 336 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  27.23 
 
 		 600 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.44 
 
 		 448 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 		 204 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.62 
 
 		 336 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  28.17 
 
 		 311 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  25.31 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1033 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.73 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.82 
 
 		 844 aa  65.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.6 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  24.4 
 
 		 870 aa  65.1  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  24.77 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  24.77 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  25.52 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  29.73 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  38.38 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  33.79 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.65 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 		 515 aa  63.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  22.14 
 
 		 872 aa  63.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  23.38 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  21.83 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  25.99 
 
 		 277 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  39.39 
 
 		 205 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  25.63 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  25.23 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  25.5 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 		 203 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  29.19 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  21.67 
 
 		 776 aa  62  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  26.76 
 
 		 250 aa  62  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  20.36 
 
 		 886 aa  61.6  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  27.57 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  31.75 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  26.54 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  26.09 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  27.14 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  26.4 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  33.62 
 
 		 184 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  25.96 
 
 		 727 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  28.19 
 
 		 408 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  31.14 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 		 291 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  28.06 
 
 		 260 aa  60.1  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 		 291 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 315 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 		 227 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  34.75 
 
 		 420 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  33.03 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  26.34 
 
 		 356 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>