292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1306 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  70.51 
 
 		 788 aa  1141    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  48.04 
 
 		 815 aa  674    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  46.4 
 
 		 925 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  62.98 
 
 		 799 aa  996    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  47.4 
 
 		 813 aa  703    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  71.57 
 
 		 784 aa  1176    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  46.93 
 
 		 785 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  47.4 
 
 		 813 aa  703    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  61.14 
 
 		 796 aa  986    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  45.8 
 
 		 971 aa  692    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  45.31 
 
 		 796 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  64.27 
 
 		 768 aa  1005    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  67.01 
 
 		 809 aa  1085    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  67.01 
 
 		 809 aa  1085    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  100 
 
 		 786 aa  1624    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  57.33 
 
 		 795 aa  920    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  57.58 
 
 		 794 aa  922    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  42.95 
 
 		 778 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  39.85 
 
 		 998 aa  541  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  35.09 
 
 		 920 aa  433  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1533  helicase  67.38 
 
 		 154 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.881721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  35.4 
 
 		 455 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1534  hypothetical protein  65.12 
 
 		 195 aa  180  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.609176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  28.6 
 
 		 479 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  27.96 
 
 		 479 aa  157  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  28.51 
 
 		 479 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  28.09 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  29.09 
 
 		 485 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  28.88 
 
 		 485 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  27.56 
 
 		 463 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0021  hypothetical protein  67.19 
 
 		 105 aa  104  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  26.46 
 
 		 654 aa  101  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0521  DNA or RNA helicase of superfamily II  44.44 
 
 		 279 aa  98.2  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0364  type III restriction enzyme, res subunit  30.65 
 
 		 473 aa  97.4  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.913598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.67 
 
 		 551 aa  92.8  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  26.16 
 
 		 560 aa  93.2  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  26.26 
 
 		 560 aa  92.8  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  29.73 
 
 		 451 aa  91.3  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  25.79 
 
 		 967 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  26.09 
 
 		 1149 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  36.94 
 
 		 456 aa  89.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 		 560 aa  89  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  26.16 
 
 		 444 aa  88.6  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  37.34 
 
 		 443 aa  88.6  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  27.87 
 
 		 773 aa  87.4  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.1 
 
 		 451 aa  86.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  34.52 
 
 		 451 aa  86.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  25.34 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  25.54 
 
 		 616 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  25.34 
 
 		 560 aa  85.5  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  25.82 
 
 		 581 aa  84.7  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  31.35 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  24.73 
 
 		 813 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  25.07 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  25.29 
 
 		 398 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  28.15 
 
 		 652 aa  82.8  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 597 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.58 
 
 		 629 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.14 
 
 		 1077 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  34.83 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  26.36 
 
 		 1063 aa  82  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.54 
 
 		 974 aa  81.6  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.69 
 
 		 812 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  25.67 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  35.56 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  25.81 
 
 		 531 aa  80.1  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  24.5 
 
 		 462 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  24.74 
 
 		 647 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  31.1 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  26.95 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  26.12 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 1055 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  26.38 
 
 		 982 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  27.79 
 
 		 607 aa  78.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  34.59 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  33.12 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 		 1061 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  26.95 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  26.95 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  26.07 
 
 		 1017 aa  78.2  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 1055 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  28.98 
 
 		 549 aa  78.2  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  26.45 
 
 		 1055 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  26.36 
 
 		 1051 aa  77.8  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  25.68 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  26.42 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  26.42 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  27.15 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  26.16 
 
 		 606 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  27.15 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  26.95 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  26.42 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  26.02 
 
 		 585 aa  77  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  26.42 
 
 		 586 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  24.66 
 
 		 580 aa  77  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  32.61 
 
 		 650 aa  76.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.4 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>