More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2303 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2303  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
137 aa  273  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2648  heat shock protein Hsp20  71.53 
 
 
137 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3092  HSP20 family protein  63.04 
 
 
138 aa  174  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0719  heat shock protein Hsp20  47.76 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.504335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3460  heat shock protein Hsp20  45.52 
 
 
137 aa  120  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.895888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1343  HSP20 family protein  46.04 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2958  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0793  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
136 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.515708  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1742  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.314982  hitchhiker  0.000988198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1076  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.713568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3665  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  34.07 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3773  heat shock protein Hsp20  37.86 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  34.85 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0315  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  28.87 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0357  Hsp20-like molecular chaperone  37.17 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1429  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
169 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  27.59 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0182  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0138231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3314  HSP20 family protein  39.18 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.284188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2410  HSP20 family protein  34.62 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.731962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5262  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.100267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
155 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0610  heat shock protein Hsp20  29.55 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  33.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  34.95 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  29.63 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  33.91 
 
 
204 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  33.33 
 
 
173 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1573  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
173 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00130938  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  34.96 
 
 
167 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  32.39 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  33.82 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  29.1 
 
 
180 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0143  heat shock protein Hsp20  32.82 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  35.04 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0188  heat shock protein Hsp20  30.94 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  34.62 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  32.33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
194 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  35.61 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  33.03 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.69 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
146 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1323  heat shock protein Hsp20  32.09 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0601396  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  35 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  30.28 
 
 
166 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0982  HSP20 family protein  32.04 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  30.19 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
195 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  32.11 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0369  HSP20 family protein  36.7 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.93231e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  31.58 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  30 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  27.01 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  31.43 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  31.62 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1559  heat shock protein Hsp20  31.4 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0277974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  28.91 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0762  heat shock protein Hsp20  35.16 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011771  BCAH820_C0008  Hsp  27.41 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1631  heat shock protein Hsp20  35.23 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0454  heat shock protein Hsp20  29.32 
 
 
144 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  31.06 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  31.06 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1159  heat shock protein Hsp20  30.77 
 
 
148 aa  57  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000413054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2042  HSP20 family protein  32.12 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0362  heat shock protein Hsp20  27.27 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.025472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  38.95 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  33.01 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  32.84 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1892  HSP20 family protein  31.87 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.684879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  29.27 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  31.34 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  31.53 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  33.64 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  32.06 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  30.6 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>