274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3173 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1579  UbiD family decarboxylase  61 
 
 		 613 aa  778    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2004  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  59.52 
 
 		 612 aa  734    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.266757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1830  UbiD family decarboxylase  57.28 
 
 		 615 aa  716    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00089461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3006  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  58.4 
 
 		 613 aa  731    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00027681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0993  carboxylyase-like protein  60.32 
 
 		 612 aa  735    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0931103  normal  0.250406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1323  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  77.33 
 
 		 649 aa  986    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.567448  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0751  Carboxylyase-related protein  61.93 
 
 		 621 aa  762    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0260  Carboxylyase-related protein  62.08 
 
 		 615 aa  753    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3015  Carboxylyase-related protein  65.18 
 
 		 610 aa  823    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1842  UbiD family decarboxylase  59.84 
 
 		 613 aa  755    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4242  UbiD family decarboxylase  56.5 
 
 		 609 aa  691    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3173  Carboxylyase-related protein  100 
 
 		 624 aa  1269    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.546258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2656  Carboxylyase-related protein  61.32 
 
 		 613 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2237  carboxylyase-like protein  59.87 
 
 		 620 aa  745    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0938  carboxylyase-like protein  80.29 
 
 		 626 aa  1031    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2913  Carboxylyase-related protein  50.08 
 
 		 610 aa  633  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00000000519936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0168  UbiD family decarboxylase  38.4 
 
 		 589 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0201007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0962  UbiD family decarboxylase  35.46 
 
 		 585 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00051781  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_002620  TC0359  hypothetical protein  32.91 
 
 		 579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  34.48 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  37 
 
 		 481 aa  203  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  31.87 
 
 		 493 aa  204  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  29.23 
 
 		 606 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.73 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  34.62 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  34.4 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  29.89 
 
 		 481 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.19 
 
 		 517 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  31.05 
 
 		 487 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  30.43 
 
 		 482 aa  192  2e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  29.11 
 
 		 617 aa  190  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  30.64 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.11 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.9 
 
 		 507 aa  188  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  31.63 
 
 		 606 aa  187  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  29.72 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.77 
 
 		 490 aa  186  9e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  30.72 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  30.56 
 
 		 495 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.98 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  29.55 
 
 		 639 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  28.23 
 
 		 621 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  29.98 
 
 		 487 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  29.59 
 
 		 485 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  29.55 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.48 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.54 
 
 		 504 aa  179  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.89 
 
 		 605 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  30.42 
 
 		 497 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  28.95 
 
 		 491 aa  177  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  30.67 
 
 		 504 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  31.83 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4478  carboxylyase-like protein  31.28 
 
 		 512 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0662178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.13 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.97 
 
 		 489 aa  174  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  28.09 
 
 		 594 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  29.64 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  29.64 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.45 
 
 		 492 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.45 
 
 		 492 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4328  carboxylyase-like protein  29.79 
 
 		 512 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.45 
 
 		 492 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0291  UbiD family decarboxylase  37.4 
 
 		 466 aa  171  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  29.21 
 
 		 498 aa  170  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.45 
 
 		 492 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  29.68 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.45 
 
 		 492 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  28.3 
 
 		 508 aa  170  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6296  UbiD family decarboxylase  31.49 
 
 		 502 aa  170  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  30.29 
 
 		 512 aa  170  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  29.68 
 
 		 486 aa  170  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.78 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  28.18 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  28.69 
 
 		 488 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.62 
 
 		 507 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.03 
 
 		 497 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.18 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.9 
 
 		 525 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0231  UbiD family decarboxylase  31.94 
 
 		 448 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  26.69 
 
 		 487 aa  167  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  28.78 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.9 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.34 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.02 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.59 
 
 		 498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.59 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.94 
 
 		 521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  27.39 
 
 		 495 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.81 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  28.81 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.81 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.81 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.25 
 
 		 506 aa  165  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  28.81 
 
 		 497 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  28.48 
 
 		 498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.6 
 
 		 497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.74 
 
 		 618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.81 
 
 		 497 aa  163  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  28.05 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.6 
 
 		 497 aa  163  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>