281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0864 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0770  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  54.83 
 
 
602 aa  691    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1045  putative periplasmic protein  55.33 
 
 
602 aa  693    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  100 
 
 
605 aa  1249    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0591  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  54.97 
 
 
600 aa  687    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.460237  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0901  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  52.4 
 
 
602 aa  645    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1321  UbiD family decarboxylase  61.06 
 
 
602 aa  775    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000596331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0766  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  52.48 
 
 
597 aa  631  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0650  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase, putative  51.07 
 
 
600 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0803638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0571  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase, putative  50.58 
 
 
600 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1384  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  50.58 
 
 
600 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  38.32 
 
 
594 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  38.03 
 
 
617 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  38.17 
 
 
639 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  34.39 
 
 
606 aa  351  2e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.39 
 
 
517 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  40.39 
 
 
509 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  41.5 
 
 
482 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  41.74 
 
 
481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  39.87 
 
 
491 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  40.39 
 
 
504 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  40.17 
 
 
504 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.47 
 
 
490 aa  335  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  33.56 
 
 
606 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  37 
 
 
493 aa  322  9.000000000000001e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  40.09 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  33.28 
 
 
621 aa  318  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  37.84 
 
 
485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  35.87 
 
 
481 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.42 
 
 
520 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  36.17 
 
 
497 aa  310  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  35.56 
 
 
504 aa  306  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  35.34 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  35 
 
 
486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  36.22 
 
 
479 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.22 
 
 
507 aa  297  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.96 
 
 
478 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  35.81 
 
 
480 aa  288  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  34.64 
 
 
463 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.02 
 
 
491 aa  259  7e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.88 
 
 
498 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0150  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.86 
 
 
613 aa  256  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000286157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.44 
 
 
498 aa  254  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.45 
 
 
495 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  29.12 
 
 
617 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.45 
 
 
498 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.45 
 
 
506 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.44 
 
 
492 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.44 
 
 
497 aa  251  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.96 
 
 
617 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.44 
 
 
492 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  32.1 
 
 
495 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.22 
 
 
492 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.22 
 
 
492 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.45 
 
 
506 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.24 
 
 
497 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31 
 
 
497 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.22 
 
 
492 aa  248  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31 
 
 
497 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  31 
 
 
497 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  31.66 
 
 
498 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.66 
 
 
490 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  31 
 
 
497 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31 
 
 
497 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  32.6 
 
 
487 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  31 
 
 
493 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.59 
 
 
501 aa  246  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  31.76 
 
 
488 aa  246  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31 
 
 
497 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4781  carboxylyase-like protein  34.58 
 
 
508 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31 
 
 
497 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  27.96 
 
 
613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31 
 
 
497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  30.79 
 
 
493 aa  244  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.79 
 
 
493 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.79 
 
 
493 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.79 
 
 
493 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  33.12 
 
 
481 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  30.57 
 
 
498 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  30.57 
 
 
488 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  31 
 
 
493 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  30.57 
 
 
493 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  32.38 
 
 
476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  29.93 
 
 
493 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  30.25 
 
 
493 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  31 
 
 
493 aa  239  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  30.57 
 
 
493 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.93 
 
 
489 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  30.57 
 
 
493 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  31.09 
 
 
488 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.93 
 
 
522 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  30.35 
 
 
493 aa  237  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.94 
 
 
482 aa  237  4e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  32.03 
 
 
488 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  30.35 
 
 
493 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  30.35 
 
 
493 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.31 
 
 
484 aa  236  7e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  31.96 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6296  UbiD family decarboxylase  31.65 
 
 
502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  31.96 
 
 
490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.85 
 
 
487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>