279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0730 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 606 aa  1220    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  79.2 
 
 		 606 aa  970    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  61.11 
 
 		 621 aa  688    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  46.47 
 
 		 639 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  45.75 
 
 		 617 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  44.85 
 
 		 594 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  51.21 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  48.58 
 
 		 491 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  50.44 
 
 		 482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  51.43 
 
 		 481 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  54.23 
 
 		 479 aa  432  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  49.34 
 
 		 493 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  50.11 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  50 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  46.28 
 
 		 482 aa  415  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  49.12 
 
 		 517 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.71 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  48.46 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  48.25 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.93 
 
 		 490 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.73 
 
 		 507 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  45.95 
 
 		 485 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  45.95 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  44.64 
 
 		 486 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  37.42 
 
 		 617 aa  368  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  37.4 
 
 		 617 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  44.42 
 
 		 486 aa  369  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  35.82 
 
 		 613 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  44.19 
 
 		 497 aa  356  6.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  42.2 
 
 		 480 aa  352  8e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0150  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.13 
 
 		 613 aa  352  8.999999999999999e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000286157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.39 
 
 		 605 aa  351  2e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0901  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.12 
 
 		 602 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.58 
 
 		 506 aa  337  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  42.48 
 
 		 493 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  42.3 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  42.92 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.14 
 
 		 498 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  42.33 
 
 		 493 aa  334  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  43.11 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1045  putative periplasmic protein  35.18 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0770  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  36.68 
 
 		 602 aa  333  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  41.68 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  41.47 
 
 		 493 aa  332  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  41.68 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  42.01 
 
 		 495 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  40.9 
 
 		 492 aa  330  4e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.48 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  41.47 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  41.47 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  40.56 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  41.25 
 
 		 493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  41.43 
 
 		 493 aa  327  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  40.26 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.92 
 
 		 497 aa  325  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  40.56 
 
 		 488 aa  324  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  42.42 
 
 		 488 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  40.48 
 
 		 498 aa  323  6e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  41.25 
 
 		 488 aa  323  8e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0766  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.95 
 
 		 597 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41.14 
 
 		 490 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  41.48 
 
 		 487 aa  320  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.26 
 
 		 497 aa  319  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.61 
 
 		 492 aa  319  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0591  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.22 
 
 		 600 aa  319  9e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.460237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.48 
 
 		 497 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  40.48 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.48 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.61 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  40.48 
 
 		 497 aa  319  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.48 
 
 		 497 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  41.77 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.48 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.04 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  41.77 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.61 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.61 
 
 		 492 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.26 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.63 
 
 		 618 aa  317  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  40.94 
 
 		 508 aa  317  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.61 
 
 		 492 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  42.01 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  40.04 
 
 		 488 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39.39 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  41.6 
 
 		 512 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.01 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  39.82 
 
 		 488 aa  313  5.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  41.14 
 
 		 488 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  40.92 
 
 		 488 aa  313  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39.61 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  41.36 
 
 		 488 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1321  UbiD family decarboxylase  33.39 
 
 		 602 aa  312  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000596331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  41.14 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>