279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0356 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  79.2 
 
 
606 aa  970    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  62.42 
 
 
621 aa  683    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  100 
 
 
606 aa  1204    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  43.57 
 
 
639 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  45.83 
 
 
617 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  44.28 
 
 
594 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  49.23 
 
 
481 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  49.34 
 
 
482 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  53.91 
 
 
479 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  51.3 
 
 
478 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  45.86 
 
 
491 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  49.23 
 
 
481 aa  422  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  48.58 
 
 
509 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  48.25 
 
 
517 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  47.51 
 
 
493 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.31 
 
 
520 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  47.37 
 
 
504 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  47.59 
 
 
504 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  45.39 
 
 
482 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  45.51 
 
 
504 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  44.86 
 
 
490 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.3 
 
 
507 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  45.08 
 
 
485 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  43.98 
 
 
486 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  43.76 
 
 
486 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  43.97 
 
 
497 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  35.44 
 
 
613 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  34.98 
 
 
617 aa  348  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  34.62 
 
 
617 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  39.61 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.05 
 
 
618 aa  337  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0770  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  36.29 
 
 
602 aa  332  1e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  39.79 
 
 
493 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0150  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  34.41 
 
 
613 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000286157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.56 
 
 
605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  40 
 
 
493 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.61 
 
 
498 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  39.28 
 
 
493 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.39 
 
 
498 aa  324  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  39.28 
 
 
493 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  39.36 
 
 
493 aa  323  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.18 
 
 
506 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  40.92 
 
 
493 aa  323  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  39.57 
 
 
493 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  40 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1045  putative periplasmic protein  35.12 
 
 
602 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  40.7 
 
 
493 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  39.07 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  39.07 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  39.96 
 
 
498 aa  320  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.04 
 
 
498 aa  319  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0901  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33 
 
 
602 aa  319  7e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  38.94 
 
 
493 aa  319  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.04 
 
 
506 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.04 
 
 
495 aa  319  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  39.28 
 
 
488 aa  318  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  40.17 
 
 
487 aa  317  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.96 
 
 
497 aa  317  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.17 
 
 
501 aa  316  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  39.36 
 
 
493 aa  316  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  39.36 
 
 
493 aa  316  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  39.36 
 
 
493 aa  316  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  38.54 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.39 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  39.61 
 
 
488 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.39 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  40.26 
 
 
488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.39 
 
 
492 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.39 
 
 
492 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  40.48 
 
 
490 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.39 
 
 
492 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  40.48 
 
 
490 aa  312  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  40.43 
 
 
488 aa  312  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.3 
 
 
497 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.52 
 
 
497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  39.52 
 
 
497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  39.52 
 
 
497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.52 
 
 
497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.52 
 
 
497 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40 
 
 
522 aa  310  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.95 
 
 
490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.3 
 
 
497 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.3 
 
 
497 aa  310  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0591  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.22 
 
 
600 aa  309  8e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.460237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  39.96 
 
 
487 aa  309  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  40.26 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0766  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.61 
 
 
597 aa  307  3e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  38.65 
 
 
498 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  43.07 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  37.66 
 
 
489 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  39.52 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  38.79 
 
 
497 aa  303  7.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  39.39 
 
 
492 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  39.08 
 
 
488 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  39.3 
 
 
488 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  38.59 
 
 
508 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  39.08 
 
 
488 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  38.95 
 
 
488 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  37.39 
 
 
502 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  40.3 
 
 
512 aa  301  3e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>