283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0677 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  65.56 
 
 		 481 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  65.7 
 
 		 481 aa  663    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  100 
 
 		 482 aa  996    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  62.37 
 
 		 479 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  58.3 
 
 		 478 aa  598  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  53.83 
 
 		 520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  54.1 
 
 		 493 aa  548  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  53.72 
 
 		 491 aa  531  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  54.13 
 
 		 639 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  54.29 
 
 		 617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  52.03 
 
 		 517 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  54.61 
 
 		 594 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  49.28 
 
 		 490 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  47.63 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  48.65 
 
 		 485 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  47.42 
 
 		 507 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  51.27 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  51.8 
 
 		 504 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  50.96 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  47.61 
 
 		 486 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  47.19 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  46.06 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  47.63 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  49.37 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  50.44 
 
 		 606 aa  448  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  45.89 
 
 		 497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  49.34 
 
 		 606 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  51.45 
 
 		 621 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  42.94 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  43.83 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  43.06 
 
 		 495 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  43.74 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.62 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  42.94 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  42.8 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  43 
 
 		 498 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0437  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  41.82 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  41.46 
 
 		 493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0215  UbiD family decarboxylase  43.92 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  41.26 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  41.46 
 
 		 493 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  41.46 
 
 		 493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  42.16 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  41.43 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  41.26 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  41.87 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  41.55 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  41.22 
 
 		 550 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  41.87 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  41.43 
 
 		 488 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.89 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  41.22 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  40.85 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.24 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  42.51 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.89 
 
 		 495 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  42.07 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.89 
 
 		 498 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  41.84 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  41.02 
 
 		 488 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0231  UbiD family decarboxylase  42.65 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  42.07 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.77 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  41.43 
 
 		 488 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.85 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  41.06 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.85 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.95 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.36 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  41.36 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.95 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  41.63 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  41.36 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  40.9 
 
 		 487 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  40.85 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.61 
 
 		 488 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.95 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.36 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.15 
 
 		 497 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.95 
 
 		 492 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.65 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.95 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.36 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.36 
 
 		 497 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  41.02 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.36 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41.22 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41.89 
 
 		 506 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  40.95 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  42.13 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0914  UbiD family decarboxylase  40.77 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4053  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.58 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0952  UbiD family decarboxylase  40.77 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0822  UbiD family decarboxylase  40.58 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  41.27 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2445  UbiD family decarboxylase  40.58 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.49 
 
 		 482 aa  385  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0473  carboxylyase-like protein  40.77 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0811  UbiD family decarboxylase  40.58 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  41.46 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>