282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0637 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  66.26 
 
 		 492 aa  717    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 508 aa  1043    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  75.63 
 
 		 507 aa  803    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  78.59 
 
 		 512 aa  829    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  74.35 
 
 		 502 aa  775    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  62.8 
 
 		 488 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  61.2 
 
 		 492 aa  624  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  61.2 
 
 		 522 aa  624  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  61.4 
 
 		 488 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  60.4 
 
 		 495 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  60.8 
 
 		 550 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  60.8 
 
 		 488 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  61 
 
 		 487 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  60.6 
 
 		 488 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  60.8 
 
 		 488 aa  621  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  59.6 
 
 		 490 aa  621  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  60.4 
 
 		 488 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  60.08 
 
 		 498 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  59.2 
 
 		 497 aa  618  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  60.75 
 
 		 498 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  60.6 
 
 		 488 aa  621  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  61.4 
 
 		 496 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  60.8 
 
 		 488 aa  618  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  60.4 
 
 		 488 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  60.4 
 
 		 488 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  60.4 
 
 		 488 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.68 
 
 		 506 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.6 
 
 		 498 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.6 
 
 		 495 aa  616  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  61 
 
 		 487 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  61 
 
 		 498 aa  616  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.88 
 
 		 498 aa  617  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.6 
 
 		 506 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  60.4 
 
 		 488 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  60.2 
 
 		 487 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.41 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  59.41 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  59.41 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.41 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  59.6 
 
 		 493 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.41 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.41 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.41 
 
 		 497 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.41 
 
 		 497 aa  611  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  59.6 
 
 		 488 aa  608  1e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.21 
 
 		 497 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  60 
 
 		 487 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  57.8 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  58.4 
 
 		 488 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  59.4 
 
 		 488 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  59 
 
 		 493 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  62 
 
 		 487 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  57.8 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  59.68 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  57.8 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  58.6 
 
 		 493 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  57.8 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  58.6 
 
 		 493 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  59.68 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  59.09 
 
 		 501 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  57.4 
 
 		 493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  58.8 
 
 		 492 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  58.8 
 
 		 492 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  58.8 
 
 		 492 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4328  carboxylyase-like protein  58.87 
 
 		 512 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  58.8 
 
 		 492 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  58.8 
 
 		 492 aa  601  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  58.4 
 
 		 493 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  58.6 
 
 		 493 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  58.4 
 
 		 493 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  58.4 
 
 		 493 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  57.6 
 
 		 493 aa  596  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  57.4 
 
 		 493 aa  594  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  58.48 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  58.33 
 
 		 503 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  61.2 
 
 		 487 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0614  UbiD family decarboxylase  57.04 
 
 		 525 aa  592  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  60.44 
 
 		 498 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2936  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  57.63 
 
 		 525 aa  591  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2698  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  59.57 
 
 		 520 aa  590  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  57 
 
 		 491 aa  588  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2578  UbiD family decarboxylase  57.2 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2151  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  57.03 
 
 		 519 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3225  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  57 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3106  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  57.03 
 
 		 578 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3075  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  57.03 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4053  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  56.65 
 
 		 518 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3106  UbiD family decarboxylase  56.6 
 
 		 522 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2591  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  57.03 
 
 		 578 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2445  UbiD family decarboxylase  56.84 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1526  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  56.84 
 
 		 536 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4478  carboxylyase-like protein  59.44 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0662178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0888  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  57.25 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  57.03 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  57.03 
 
 		 519 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0758  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  57.03 
 
 		 519 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0132  carboxylyase-like protein  57.17 
 
 		 494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0914  UbiD family decarboxylase  56.46 
 
 		 518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0473  carboxylyase-like protein  56.46 
 
 		 551 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0952  UbiD family decarboxylase  56.46 
 
 		 518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>