281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0242 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  100 
 
 		 618 aa  1267    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  49.84 
 
 		 617 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0150  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  48.86 
 
 		 613 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000286157  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  49.35 
 
 		 617 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  48.61 
 
 		 613 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  58.26 
 
 		 493 aa  538  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.77 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  57.05 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  56.61 
 
 		 493 aa  534  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.99 
 
 		 498 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  56.83 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  56.83 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  57.05 
 
 		 493 aa  535  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.99 
 
 		 506 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  56.33 
 
 		 493 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  57.05 
 
 		 493 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  56.61 
 
 		 493 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  56.61 
 
 		 493 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  54.86 
 
 		 498 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  57.58 
 
 		 495 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  55.56 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  55.95 
 
 		 493 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  57.45 
 
 		 522 aa  529  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  56.61 
 
 		 493 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  56.61 
 
 		 493 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  56.61 
 
 		 493 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.96 
 
 		 498 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.96 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  55.19 
 
 		 492 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  55.19 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  55.19 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  55.17 
 
 		 501 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  57.27 
 
 		 493 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.9 
 
 		 497 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  55.19 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  57.05 
 
 		 493 aa  526  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.68 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  56.68 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.4 
 
 		 506 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.68 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  54.99 
 
 		 492 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.68 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.47 
 
 		 497 aa  522  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.68 
 
 		 497 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  56.47 
 
 		 497 aa  525  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  56.68 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  56.21 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  54.51 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  53.94 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  56.16 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  53.39 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  57.36 
 
 		 507 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  56.46 
 
 		 490 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  55.53 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  56.89 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  54.51 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  57.27 
 
 		 488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  56.8 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  53.27 
 
 		 492 aa  515  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  54.8 
 
 		 488 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  55.95 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  56.22 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  55.24 
 
 		 488 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  54.73 
 
 		 550 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  53.28 
 
 		 497 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  52.86 
 
 		 488 aa  512  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  54.73 
 
 		 488 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  54.73 
 
 		 488 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  55.82 
 
 		 487 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  54.73 
 
 		 488 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  56.17 
 
 		 487 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  55.81 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  55.41 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  53.48 
 
 		 487 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  56.96 
 
 		 487 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2578  UbiD family decarboxylase  57.05 
 
 		 494 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3225  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  57.26 
 
 		 494 aa  501  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  53.93 
 
 		 490 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  53.93 
 
 		 490 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  52.89 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  55.43 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  55.43 
 
 		 488 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4053  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  52.87 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2445  UbiD family decarboxylase  53.07 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  53.81 
 
 		 503 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  53.6 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0914  UbiD family decarboxylase  52.66 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0473  carboxylyase-like protein  52.66 
 
 		 551 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0952  UbiD family decarboxylase  52.66 
 
 		 518 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3106  UbiD family decarboxylase  51.63 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3106  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  51.72 
 
 		 578 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1526  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  52.12 
 
 		 536 aa  485  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0132  carboxylyase-like protein  52.93 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0822  UbiD family decarboxylase  52.66 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0888  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  52.03 
 
 		 522 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3075  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  51.72 
 
 		 519 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0811  UbiD family decarboxylase  52.66 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  51.72 
 
 		 519 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0758  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  51.52 
 
 		 519 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  51.52 
 
 		 519 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>