282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3063 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3225  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  66.53 
 
 		 494 aa  694    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  74.34 
 
 		 497 aa  783    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  74.14 
 
 		 497 aa  780    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  74.14 
 
 		 497 aa  780    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  68.6 
 
 		 490 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  67.63 
 
 		 493 aa  724    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  74.49 
 
 		 488 aa  778    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  74.49 
 
 		 550 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1020    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  75.51 
 
 		 498 aa  782    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0708  hypothetical protein  70.2 
 
 		 503 aa  711    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  70.73 
 
 		 497 aa  743    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  72.75 
 
 		 498 aa  766    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  77.78 
 
 		 487 aa  803    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  68.25 
 
 		 488 aa  726    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  74.07 
 
 		 488 aa  772    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2151  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.31 
 
 		 519 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  70.99 
 
 		 488 aa  735    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  70.99 
 
 		 488 aa  734    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  68.87 
 
 		 493 aa  733    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  75.67 
 
 		 488 aa  788    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  74.07 
 
 		 492 aa  774    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  74.28 
 
 		 487 aa  759    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  73.94 
 
 		 497 aa  778    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0765  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  69.26 
 
 		 533 aa  691    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3075  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.12 
 
 		 519 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.31 
 
 		 519 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79917  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  76.29 
 
 		 487 aa  759    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3106  UbiD family decarboxylase  66.79 
 
 		 522 aa  714    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3106  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.12 
 
 		 578 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  77.16 
 
 		 487 aa  805    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  67.84 
 
 		 493 aa  722    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  72.43 
 
 		 488 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  68.6 
 
 		 490 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  75 
 
 		 506 aa  775    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  67.84 
 
 		 493 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4053  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  66.92 
 
 		 518 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2936  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  66.03 
 
 		 525 aa  686    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.98015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  75.1 
 
 		 492 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  73.74 
 
 		 497 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  67.84 
 
 		 493 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  69.37 
 
 		 617 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  68.25 
 
 		 493 aa  726    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  74.34 
 
 		 497 aa  783    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0614  UbiD family decarboxylase  66.6 
 
 		 525 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  74.07 
 
 		 487 aa  781    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  74.9 
 
 		 498 aa  774    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  75.1 
 
 		 492 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2445  UbiD family decarboxylase  66.73 
 
 		 518 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  74.14 
 
 		 497 aa  780    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1526  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.12 
 
 		 536 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74472  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  75.31 
 
 		 492 aa  786    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  74.14 
 
 		 497 aa  780    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  68.25 
 
 		 493 aa  723    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  74.69 
 
 		 488 aa  767    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0758  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.31 
 
 		 519 aa  715    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0132  carboxylyase-like protein  68.5 
 
 		 494 aa  710    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  75.26 
 
 		 490 aa  778    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  75.1 
 
 		 492 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2578  UbiD family decarboxylase  66.73 
 
 		 494 aa  694    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0888  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  66.99 
 
 		 522 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.12 
 
 		 519 aa  715    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  73.68 
 
 		 501 aa  772    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  69.2 
 
 		 503 aa  724    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2591  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  67.31 
 
 		 578 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  74.69 
 
 		 488 aa  780    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  67.84 
 
 		 493 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  68.45 
 
 		 493 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2925  UbiD family decarboxylase  64.22 
 
 		 524 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.769934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  70 
 
 		 503 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  75.56 
 
 		 522 aa  794    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2698  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  68.34 
 
 		 520 aa  693    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  74.14 
 
 		 497 aa  780    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  74.69 
 
 		 488 aa  780    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0473  carboxylyase-like protein  66.73 
 
 		 551 aa  718    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  75.1 
 
 		 492 aa  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  68.04 
 
 		 493 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  70.08 
 
 		 491 aa  734    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  67.84 
 
 		 493 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  68.04 
 
 		 493 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  77.16 
 
 		 488 aa  807    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  67.84 
 
 		 493 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0914  UbiD family decarboxylase  66.73 
 
 		 518 aa  718    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  61.68 
 
 		 502 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0811  UbiD family decarboxylase  66.73 
 
 		 518 aa  716    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  74.69 
 
 		 488 aa  765    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  75.46 
 
 		 488 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  73.87 
 
 		 488 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0952  UbiD family decarboxylase  66.73 
 
 		 518 aa  718    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0822  UbiD family decarboxylase  66.73 
 
 		 518 aa  716    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  72.75 
 
 		 506 aa  766    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0150  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  69.21 
 
 		 613 aa  679    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000286157  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  68.04 
 
 		 493 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  72.54 
 
 		 495 aa  765    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  73.33 
 
 		 496 aa  757    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  69 
 
 		 613 aa  671    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  74.33 
 
 		 488 aa  775    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  68.04 
 
 		 493 aa  728    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  69.26 
 
 		 489 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  76.34 
 
 		 495 aa  791    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>