281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1270 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  100 
 
 
482 aa  978    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  67.3 
 
 
491 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  49.37 
 
 
482 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  50.21 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  48.95 
 
 
481 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  48.12 
 
 
493 aa  456  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.4 
 
 
517 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  48.85 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  46.96 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  47.32 
 
 
478 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  46.36 
 
 
509 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  46.17 
 
 
606 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  45.19 
 
 
504 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  45.61 
 
 
504 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  44.21 
 
 
490 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  45.44 
 
 
485 aa  418  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  44.78 
 
 
504 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  44.99 
 
 
507 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  45.49 
 
 
606 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  47.47 
 
 
639 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  43.76 
 
 
486 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  43.44 
 
 
497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.55 
 
 
520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  43.67 
 
 
486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  43.65 
 
 
617 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  44.79 
 
 
594 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  47.46 
 
 
621 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.87 
 
 
482 aa  352  8.999999999999999e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1045  putative periplasmic protein  40.58 
 
 
602 aa  352  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158782  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0591  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41.96 
 
 
600 aa  352  1e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.460237  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  40.8 
 
 
476 aa  351  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0901  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.38 
 
 
602 aa  345  1e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0770  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  40.86 
 
 
602 aa  342  9e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.17 
 
 
484 aa  341  1e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0766  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  41.48 
 
 
597 aa  341  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.09 
 
 
605 aa  332  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.68 
 
 
490 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1321  UbiD family decarboxylase  39.78 
 
 
602 aa  327  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000596331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  36.89 
 
 
493 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.22 
 
 
493 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.22 
 
 
493 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.22 
 
 
493 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  36.89 
 
 
493 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1757  UbiD family decarboxylase  41.05 
 
 
477 aa  325  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122512  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  38.7 
 
 
481 aa  325  2e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  36.89 
 
 
493 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.27 
 
 
506 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  36.89 
 
 
493 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  39.87 
 
 
463 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  36.48 
 
 
493 aa  323  4e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  36.68 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  36.68 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  35.86 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.23 
 
 
498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  36.89 
 
 
493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.02 
 
 
498 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0773  UbiD family decarboxylase  40 
 
 
477 aa  320  3e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632709  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  36.61 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
492 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
492 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
492 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
492 aa  319  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  36.02 
 
 
495 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.49 
 
 
497 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  35.86 
 
 
493 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  36.68 
 
 
493 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.54 
 
 
525 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
492 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  36.07 
 
 
493 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.82 
 
 
501 aa  315  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  37.14 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.27 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  36.05 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  36.08 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.2 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.88 
 
 
497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.43 
 
 
498 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.43 
 
 
495 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  36.08 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
497 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.43 
 
 
506 aa  312  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.08 
 
 
497 aa  312  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.88 
 
 
497 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  35.04 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  37.11 
 
 
492 aa  310  4e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  36.46 
 
 
509 aa  309  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.34 
 
 
497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.42 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  34.84 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  36.08 
 
 
487 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  35.39 
 
 
488 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  35.8 
 
 
488 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  35.6 
 
 
488 aa  307  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  35.38 
 
 
498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1384  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39 
 
 
600 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  37.39 
 
 
613 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.09 
 
 
521 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  35.92 
 
 
492 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>