281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1697 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  67.29 
 
 		 481 aa  710    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  100 
 
 		 484 aa  983    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.68 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  46.44 
 
 		 476 aa  426  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  46.71 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  44.08 
 
 		 491 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0773  UbiD family decarboxylase  44.7 
 
 		 477 aa  391  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632709  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1757  UbiD family decarboxylase  44.91 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  40.66 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  41.75 
 
 		 479 aa  360  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39.29 
 
 		 482 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41.16 
 
 		 478 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  40.87 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.31 
 
 		 520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  37.6 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.04 
 
 		 517 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  38.27 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  40.17 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.65 
 
 		 490 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  36.46 
 
 		 504 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  36.98 
 
 		 617 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  36.8 
 
 		 486 aa  316  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  37.01 
 
 		 486 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  36.46 
 
 		 504 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  35.31 
 
 		 487 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.98 
 
 		 491 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.43 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.22 
 
 		 506 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  35.31 
 
 		 487 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.22 
 
 		 498 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  36.25 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.7 
 
 		 501 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.38 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.41 
 
 		 498 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  34.61 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.88 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.88 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.17 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  35.17 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.52 
 
 		 490 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  35.8 
 
 		 487 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.22 
 
 		 498 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.97 
 
 		 497 aa  306  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.88 
 
 		 493 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  36.9 
 
 		 497 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  35.04 
 
 		 488 aa  305  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.96 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  34.97 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.97 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  34.41 
 
 		 487 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.97 
 
 		 497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.97 
 
 		 497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  34.7 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.7 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.61 
 
 		 506 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.7 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.7 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.7 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  34.69 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  34.02 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  34.7 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  33.68 
 
 		 493 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.61 
 
 		 522 aa  300  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.99 
 
 		 507 aa  299  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  33.68 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  33.68 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  34.02 
 
 		 493 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.2 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  34.29 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  33.68 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  33.47 
 
 		 493 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  33.47 
 
 		 493 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  33.47 
 
 		 493 aa  296  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  34.5 
 
 		 493 aa  295  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  34.27 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  35.26 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  33.26 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  36.1 
 
 		 504 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  34.7 
 
 		 489 aa  293  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.93 
 
 		 502 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  33.06 
 
 		 498 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  33.88 
 
 		 488 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  34.16 
 
 		 488 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  34.09 
 
 		 493 aa  293  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.92 
 
 		 487 aa  293  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  33.06 
 
 		 488 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  33.67 
 
 		 488 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  32.85 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  32.85 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  33.27 
 
 		 488 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  33.88 
 
 		 488 aa  292  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.47 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  33.27 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  35.19 
 
 		 502 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  33.8 
 
 		 493 aa  289  8e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  33.27 
 
 		 492 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.47 
 
 		 488 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.75 
 
 		 525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  35.45 
 
 		 594 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0571  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase, putative  33.85 
 
 		 600 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>