282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2588 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2042  UbiD family decarboxylase  82.44 
 
 		 502 aa  867    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527905  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0050  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  67.74 
 
 		 525 aa  733    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  83.23 
 
 		 502 aa  878    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  73.75 
 
 		 520 aa  783    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1132  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  73.75 
 
 		 520 aa  781    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10361  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  66 
 
 		 509 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  100 
 
 		 506 aa  1030    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0006  UbiD family decarboxylase  81.64 
 
 		 502 aa  872    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06711  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  67.94 
 
 		 525 aa  736    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  82.07 
 
 		 504 aa  863    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18901  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  71.74 
 
 		 521 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.358341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  80.64 
 
 		 502 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  80.64 
 
 		 502 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  49.28 
 
 		 522 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  49.38 
 
 		 487 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  46.5 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  47.29 
 
 		 489 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  46.69 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.31 
 
 		 498 aa  462  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  46.5 
 
 		 493 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  45.88 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  45.88 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  46.9 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.94 
 
 		 506 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  46.3 
 
 		 493 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  45.88 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  45.88 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.3 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.3 
 
 		 493 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.3 
 
 		 493 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.53 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  47.53 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.74 
 
 		 497 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  47.53 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  45.57 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.49 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.53 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  45.47 
 
 		 493 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  47.11 
 
 		 498 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.53 
 
 		 497 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.28 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.33 
 
 		 497 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.93 
 
 		 501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.91 
 
 		 490 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  46.28 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.28 
 
 		 495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  45.79 
 
 		 493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.33 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.28 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  47.53 
 
 		 497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  45.87 
 
 		 550 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.91 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.91 
 
 		 492 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.91 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.49 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  45.06 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  45.87 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  47.36 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.91 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  46.91 
 
 		 492 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  46.07 
 
 		 488 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  46.49 
 
 		 488 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  46.49 
 
 		 492 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  47.52 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  46.09 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  45.87 
 
 		 488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  46.28 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.66 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  47.11 
 
 		 487 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  45.66 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  47 
 
 		 488 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  47.52 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  47.01 
 
 		 495 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  45.87 
 
 		 488 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  45.66 
 
 		 488 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0177  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  46.41 
 
 		 497 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.89 
 
 		 507 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  45.88 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.66 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  44.35 
 
 		 502 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0637  UbiD family decarboxylase  45.25 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  44.65 
 
 		 503 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0132  carboxylyase-like protein  44.81 
 
 		 494 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4328  carboxylyase-like protein  44.56 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.55 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  45.87 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1315  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  43.58 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0561345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  44.51 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  44.72 
 
 		 488 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  44.47 
 
 		 617 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  43.84 
 
 		 503 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0150  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  46.24 
 
 		 613 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000286157  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3106  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  43.65 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4053  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  44.32 
 
 		 518 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  43.85 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79917  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1526  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  43.85 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74472  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4478  carboxylyase-like protein  45.08 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0662178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  43.65 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1001  UbiD family decarboxylase  45.6 
 
 		 512 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2591  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  43.85 
 
 		 578 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>