281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0497 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0773  UbiD family decarboxylase  83.68 
 
 		 477 aa  786    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632709  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1757  UbiD family decarboxylase  84.73 
 
 		 477 aa  795    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0497  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  100 
 
 		 482 aa  953    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  84.28 
 
 		 476 aa  821    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1864  UbiD family decarboxylase  45.15 
 
 		 481 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1697  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.68 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.373117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  44.14 
 
 		 480 aa  414  1e-114  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  44.56 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  48.39 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  43.13 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  47.57 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.94 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  42.49 
 
 		 482 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  45.91 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1236  UbiD family decarboxylase  43.78 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0407315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  41.54 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.37 
 
 		 517 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  40.57 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  39.92 
 
 		 488 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  40.5 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.16 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.3 
 
 		 501 aa  345  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  41.63 
 
 		 486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39.14 
 
 		 488 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  39.26 
 
 		 488 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  39.34 
 
 		 492 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  41.63 
 
 		 486 aa  342  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  41.43 
 
 		 487 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.09 
 
 		 497 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.09 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.68 
 
 		 492 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.25 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.25 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  39.09 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.68 
 
 		 492 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.25 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  39.21 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.68 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  40.87 
 
 		 482 aa  340  2.9999999999999998e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.68 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.89 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.14 
 
 		 497 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.93 
 
 		 498 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  38.89 
 
 		 497 aa  339  7e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  39.13 
 
 		 550 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.89 
 
 		 497 aa  339  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  39.13 
 
 		 488 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.89 
 
 		 497 aa  339  7e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  40.69 
 
 		 496 aa  339  8e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.68 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.93 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  38.8 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.89 
 
 		 497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.3 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41.84 
 
 		 507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  42.18 
 
 		 490 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  40.82 
 
 		 487 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  38.8 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.57 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  39.42 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39.42 
 
 		 490 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  38.8 
 
 		 495 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  38.93 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  40.5 
 
 		 487 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  40.94 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.65 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.65 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.65 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  39.42 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  38.54 
 
 		 488 aa  329  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  40.33 
 
 		 488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  38.54 
 
 		 488 aa  329  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  41.74 
 
 		 504 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  41.98 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  41.03 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  38.54 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  37.86 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  38.24 
 
 		 488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  39.31 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  41.31 
 
 		 504 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  39.43 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  37.83 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  38.49 
 
 		 493 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  39.75 
 
 		 617 aa  325  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  38.68 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  38.04 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  37.42 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  37.42 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  39.68 
 
 		 503 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  40.59 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  40.08 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  37.22 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  37.22 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  37.2 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  39.87 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.51 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  41.34 
 
 		 487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0614  UbiD family decarboxylase  38.87 
 
 		 525 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.168716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  40.16 
 
 		 487 aa  319  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  37.88 
 
 		 493 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>