281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3212 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  60.6 
 
 		 617 aa  734    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  100 
 
 		 594 aa  1226    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  56.95 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  44.84 
 
 		 639 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  54.61 
 
 		 482 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  52.08 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  44.85 
 
 		 606 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  44.28 
 
 		 606 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  54.26 
 
 		 479 aa  475  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  52.05 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  48.07 
 
 		 520 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  49.34 
 
 		 491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  43.96 
 
 		 621 aa  445  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  48.6 
 
 		 493 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.32 
 
 		 605 aa  436  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  49.13 
 
 		 509 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  46.92 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0901  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.31 
 
 		 602 aa  423  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.875332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  47.28 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0770  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase) (SerRS)  38.89 
 
 		 602 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  46.04 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1321  UbiD family decarboxylase  37.42 
 
 		 602 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000596331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  45.59 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  45.2 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1045  putative periplasmic protein  37.24 
 
 		 602 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.158782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  44.66 
 
 		 497 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  47.06 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  46.19 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  45.37 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0591  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.36 
 
 		 600 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.460237  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0650  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase, putative  35.46 
 
 		 600 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0803638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1384  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  35.46 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  46.59 
 
 		 463 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0571  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase, putative  35.29 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  44.79 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  43.67 
 
 		 507 aa  389  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0766  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  35.29 
 
 		 597 aa  376  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  41.37 
 
 		 480 aa  373  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0215  UbiD family decarboxylase  45.86 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0231  UbiD family decarboxylase  43.61 
 
 		 448 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  39.87 
 
 		 489 aa  362  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  40.3 
 
 		 487 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.45 
 
 		 506 aa  356  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  39.45 
 
 		 487 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  40.51 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  40.3 
 
 		 487 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  39.35 
 
 		 495 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  38.81 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  39.23 
 
 		 522 aa  351  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.02 
 
 		 497 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3389  UbiD family decarboxylase  39.02 
 
 		 493 aa  350  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0437  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  41.9 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.02 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  39.02 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.81 
 
 		 498 aa  349  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.02 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  39.02 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  39.02 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.81 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.02 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  39.45 
 
 		 493 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  39.02 
 
 		 497 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.59 
 
 		 492 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.59 
 
 		 492 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.81 
 
 		 497 aa  347  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.59 
 
 		 492 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.59 
 
 		 492 aa  347  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.59 
 
 		 497 aa  346  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  38.59 
 
 		 492 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  38.38 
 
 		 487 aa  345  8.999999999999999e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  38.59 
 
 		 493 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  39.57 
 
 		 488 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  38.59 
 
 		 488 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  38.17 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  38.17 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  38.17 
 
 		 493 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  38.17 
 
 		 493 aa  343  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3525  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.38 
 
 		 493 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.38 
 
 		 493 aa  343  8e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0657  UbiD family decarboxylase  39.67 
 
 		 503 aa  342  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0892481 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  37.74 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.49 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  37.95 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  38.17 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  37.74 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  37.74 
 
 		 506 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  37.74 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0506  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.38 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  38.94 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0132  carboxylyase-like protein  39.08 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  37.45 
 
 		 501 aa  340  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0701  UbiD family decarboxylase  39.18 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  38.49 
 
 		 496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  38.28 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  33.94 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  34.22 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  38.28 
 
 		 488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  38.49 
 
 		 488 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  38.92 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3059  carboxylyase-like protein  38.17 
 
 		 493 aa  336  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>