279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0359 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0359  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1181    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0168  UbiD family decarboxylase  51.2 
 
 
589 aa  598  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0201007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0962  UbiD family decarboxylase  49.23 
 
 
585 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00051781  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2004  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  35.21 
 
 
612 aa  345  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.266757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2913  Carboxylyase-related protein  36.73 
 
 
610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00000000519936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3006  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.66 
 
 
613 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00027681  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0260  Carboxylyase-related protein  35.74 
 
 
615 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1842  UbiD family decarboxylase  35.47 
 
 
613 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1323  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  32.89 
 
 
649 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.567448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0993  carboxylyase-like protein  35.03 
 
 
612 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0931103  normal  0.250406 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0751  Carboxylyase-related protein  34.43 
 
 
621 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3015  Carboxylyase-related protein  34.5 
 
 
610 aa  327  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0938  carboxylyase-like protein  34.71 
 
 
626 aa  326  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2656  Carboxylyase-related protein  36.16 
 
 
613 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4242  UbiD family decarboxylase  34.66 
 
 
609 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1579  UbiD family decarboxylase  35.82 
 
 
613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2237  carboxylyase-like protein  34.11 
 
 
620 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1830  UbiD family decarboxylase  34.76 
 
 
615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00089461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3173  Carboxylyase-related protein  32.59 
 
 
624 aa  309  8e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.546258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  37.1 
 
 
481 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.1 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  35.6 
 
 
481 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.39 
 
 
490 aa  259  8e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  36.12 
 
 
479 aa  257  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  34.51 
 
 
639 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.91 
 
 
478 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  36.38 
 
 
509 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  34.3 
 
 
617 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  31.61 
 
 
606 aa  250  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.17 
 
 
517 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  35.07 
 
 
504 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  35.21 
 
 
504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  31.56 
 
 
480 aa  239  9e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.02 
 
 
507 aa  239  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  32.89 
 
 
493 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  30.85 
 
 
594 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  34.44 
 
 
504 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.67 
 
 
490 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  33.18 
 
 
486 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.59 
 
 
492 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  33.18 
 
 
486 aa  230  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.37 
 
 
501 aa  230  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.46 
 
 
522 aa  230  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  32.57 
 
 
485 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.59 
 
 
492 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.59 
 
 
492 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.59 
 
 
492 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.59 
 
 
492 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  33.81 
 
 
463 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.92 
 
 
497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  31.92 
 
 
497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  31.92 
 
 
497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.92 
 
 
497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.92 
 
 
497 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.92 
 
 
497 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.7 
 
 
497 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.92 
 
 
497 aa  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.7 
 
 
497 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  31.93 
 
 
606 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  31.03 
 
 
487 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.54 
 
 
498 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.7 
 
 
498 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.6 
 
 
506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  33.11 
 
 
491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  32.23 
 
 
495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  31.77 
 
 
498 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  31.58 
 
 
493 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4328  carboxylyase-like protein  32 
 
 
512 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0360  UbiD family decarboxylase  31.59 
 
 
493 aa  220  7e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.375206  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  31.57 
 
 
498 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  32.37 
 
 
497 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.91 
 
 
498 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.91 
 
 
506 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.13 
 
 
495 aa  218  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  33.41 
 
 
621 aa  218  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  31.78 
 
 
493 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  31.84 
 
 
488 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  32.43 
 
 
482 aa  217  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.26 
 
 
520 aa  217  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  30.8 
 
 
488 aa  216  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3063  hypothetical protein  32.73 
 
 
498 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3803  UbiD family decarboxylase  31.66 
 
 
493 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3859  UbiD family decarboxylase  31.66 
 
 
493 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3985  UbiD family decarboxylase  31.66 
 
 
493 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0465  UbiD family decarboxylase  31.66 
 
 
493 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4444  UbiD family decarboxylase  31.11 
 
 
493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  30.24 
 
 
506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.49 
 
 
491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.24 
 
 
618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0521  UbiD family decarboxylase  30.92 
 
 
493 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  30.87 
 
 
488 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0705  UbiD family decarboxylase  31.76 
 
 
476 aa  213  7e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.1 
 
 
502 aa  213  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  30.5 
 
 
512 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3352  UbiD family decarboxylase  31.21 
 
 
493 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  30.38 
 
 
504 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.8 
 
 
489 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  30.47 
 
 
504 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0506  hypothetical protein  31.11 
 
 
488 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  30.43 
 
 
487 aa  211  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>