272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2237 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2656  Carboxylyase-related protein  66.5 
 
 		 613 aa  836    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0260  Carboxylyase-related protein  58.47 
 
 		 615 aa  718    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2004  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  65.91 
 
 		 612 aa  815    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.266757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2913  Carboxylyase-related protein  53.75 
 
 		 610 aa  683    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00000000519936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0751  Carboxylyase-related protein  56.66 
 
 		 621 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3173  Carboxylyase-related protein  59.87 
 
 		 624 aa  743    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.546258 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4242  UbiD family decarboxylase  61.27 
 
 		 609 aa  770    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3006  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  62.15 
 
 		 613 aa  787    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00027681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0993  carboxylyase-like protein  66.78 
 
 		 612 aa  825    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0931103  normal  0.250406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1323  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  58.7 
 
 		 649 aa  738    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.567448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0938  carboxylyase-like protein  60.36 
 
 		 626 aa  771    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3015  Carboxylyase-related protein  58.59 
 
 		 610 aa  729    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1830  UbiD family decarboxylase  67.75 
 
 		 615 aa  842    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00089461  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2237  carboxylyase-like protein  100 
 
 		 620 aa  1264    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1579  UbiD family decarboxylase  66.01 
 
 		 613 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1842  UbiD family decarboxylase  67.54 
 
 		 613 aa  862    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0168  UbiD family decarboxylase  38.75 
 
 		 589 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0201007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0962  UbiD family decarboxylase  37.81 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00051781  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_002620  TC0359  hypothetical protein  33.93 
 
 		 579 aa  310  4e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  33.17 
 
 		 606 aa  232  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  34.12 
 
 		 617 aa  220  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.54 
 
 		 482 aa  219  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  32.14 
 
 		 639 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.34 
 
 		 507 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  30.14 
 
 		 606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  35.92 
 
 		 509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  30.39 
 
 		 481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  32.7 
 
 		 493 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.26 
 
 		 517 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.83 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  30.34 
 
 		 621 aa  210  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  29.02 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  32.47 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  33.76 
 
 		 479 aa  209  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  32.13 
 
 		 487 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  35.7 
 
 		 504 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  32.56 
 
 		 504 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  33.05 
 
 		 504 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  31.47 
 
 		 480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.91 
 
 		 504 aa  201  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  32.35 
 
 		 481 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  31.28 
 
 		 488 aa  198  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  31.09 
 
 		 482 aa  197  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.03 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.7 
 
 		 522 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.48 
 
 		 504 aa  196  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  31.49 
 
 		 487 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  33.18 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0231  UbiD family decarboxylase  35.52 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  31.54 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  32.63 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30.43 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  30.53 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  30.85 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  30.64 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4328  carboxylyase-like protein  30.85 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2013  UbiD family decarboxylase  35.71 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.920349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2383  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  35.71 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  31.57 
 
 		 488 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  29.57 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.96 
 
 		 490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  30.64 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4478  carboxylyase-like protein  31.91 
 
 		 512 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0662178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47400  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.51 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6296  UbiD family decarboxylase  34.04 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  24.22 
 
 		 617 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  29.68 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  30.13 
 
 		 495 aa  189  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  31.37 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1001  UbiD family decarboxylase  31.49 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.96 
 
 		 605 aa  186  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4781  carboxylyase-like protein  31.21 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.588855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  30.49 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  30.21 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  24.42 
 
 		 617 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.66 
 
 		 489 aa  185  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  28.87 
 
 		 491 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0591  3-polyprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.76 
 
 		 600 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.460237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  30.36 
 
 		 487 aa  183  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0650  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase, putative  29.75 
 
 		 600 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0803638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  29.36 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2151  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.44 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3001  hypothetical protein  30.36 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.44 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0758  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.44 
 
 		 519 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.57 
 
 		 488 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2591  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.44 
 
 		 578 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  29.55 
 
 		 498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  30.36 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3022  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.23 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3106  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.23 
 
 		 578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3075  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.23 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0215  UbiD family decarboxylase  37.83 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0571  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase, putative  29.75 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1526  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.23 
 
 		 536 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.6 
 
 		 502 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4053  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.03 
 
 		 518 aa  180  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1384  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.33 
 
 		 600 aa  179  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  32.1 
 
 		 463 aa  180  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>