276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0168 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0962  UbiD family decarboxylase  56.95 
 
 
585 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00051781  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0168  UbiD family decarboxylase  100 
 
 
589 aa  1183    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0201007  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0359  hypothetical protein  51.03 
 
 
579 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1323  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  39.37 
 
 
649 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.567448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0260  Carboxylyase-related protein  40.39 
 
 
615 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4242  UbiD family decarboxylase  39.7 
 
 
609 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0751  Carboxylyase-related protein  40.62 
 
 
621 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2004  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  40.52 
 
 
612 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.266757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2656  Carboxylyase-related protein  38.27 
 
 
613 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0938  carboxylyase-like protein  38.56 
 
 
626 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1830  UbiD family decarboxylase  39.47 
 
 
615 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00089461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1842  UbiD family decarboxylase  39.18 
 
 
613 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1579  UbiD family decarboxylase  37.99 
 
 
613 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3173  Carboxylyase-related protein  37.34 
 
 
624 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.546258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2237  carboxylyase-like protein  38.75 
 
 
620 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3015  Carboxylyase-related protein  37.56 
 
 
610 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3006  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  38.09 
 
 
613 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00027681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0993  carboxylyase-like protein  39.41 
 
 
612 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0931103  normal  0.250406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2913  Carboxylyase-related protein  36.07 
 
 
610 aa  359  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00000000519936 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  36.38 
 
 
480 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  35.11 
 
 
617 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  36.48 
 
 
482 aa  300  7e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  38.72 
 
 
481 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  38.32 
 
 
490 aa  286  9e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  39.29 
 
 
479 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  36.92 
 
 
481 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  38.5 
 
 
485 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  39.57 
 
 
478 aa  280  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  37.94 
 
 
507 aa  277  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  32.74 
 
 
594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8073  UbiD family decarboxylase  37.58 
 
 
497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  36.95 
 
 
486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4514  UbiD family decarboxylase  36.73 
 
 
486 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  34.97 
 
 
487 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  36.62 
 
 
504 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  35.53 
 
 
493 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.95 
 
 
522 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.97 
 
 
497 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.04 
 
 
490 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  34.82 
 
 
606 aa  257  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  34.52 
 
 
488 aa  256  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  33.76 
 
 
497 aa  256  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  33.77 
 
 
639 aa  256  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.76 
 
 
497 aa  256  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.76 
 
 
497 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.76 
 
 
497 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  33.76 
 
 
497 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  36.65 
 
 
517 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5282  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.064348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  33.62 
 
 
487 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  33.44 
 
 
606 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4224  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
497 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514143  hitchhiker  0.00200609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
497 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  34.73 
 
 
488 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.83 
 
 
491 aa  252  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  28.46 
 
 
617 aa  252  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
492 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  32.41 
 
 
489 aa  251  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
492 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  33.33 
 
 
621 aa  251  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
492 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
492 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.55 
 
 
492 aa  249  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  33.76 
 
 
498 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00334  3-polyprenyl-4-hydrozybenzoate decarboxylase  27.97 
 
 
617 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  33.26 
 
 
501 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  33.18 
 
 
487 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  32.61 
 
 
488 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  33.19 
 
 
488 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  33.85 
 
 
487 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  34.35 
 
 
495 aa  246  8e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4281  UbiD family decarboxylase  35.98 
 
 
463 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0310  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.06 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  32.98 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  36.59 
 
 
509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.7 
 
 
506 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.12 
 
 
506 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.83 
 
 
498 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4238  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  32.61 
 
 
498 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  33.33 
 
 
498 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2702  hypothetical protein  28.57 
 
 
613 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.69 
 
 
506 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.69 
 
 
498 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  31.69 
 
 
495 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  36.26 
 
 
504 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  36.2 
 
 
504 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0415  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.28 
 
 
487 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.138941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1967  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.29 
 
 
520 aa  240  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0826  UbiD family decarboxylase  33.62 
 
 
496 aa  240  6.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0150  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  27.69 
 
 
613 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000286157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0437  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  35.98 
 
 
471 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0426  carboxylyase-related protein  33.98 
 
 
493 aa  237  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  33.47 
 
 
502 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0104  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  35.41 
 
 
487 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.226437  normal  0.0216284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  33.5 
 
 
491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  34.17 
 
 
507 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0354  UbiD family decarboxylase  34.85 
 
 
512 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4328  carboxylyase-like protein  34.95 
 
 
512 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0505  UbiD family decarboxylase  32.47 
 
 
493 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2862  hypothetical protein  32.82 
 
 
488 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>