274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2913 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0938  carboxylyase-like protein  50.25 
 
 
626 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1830  UbiD family decarboxylase  54.96 
 
 
615 aa  691    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00089461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2004  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  54.15 
 
 
612 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.266757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3006  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  51.71 
 
 
613 aa  645    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00027681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2656  Carboxylyase-related protein  54.08 
 
 
613 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0993  carboxylyase-like protein  53.75 
 
 
612 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0931103  normal  0.250406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1579  UbiD family decarboxylase  53.27 
 
 
613 aa  681    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2913  Carboxylyase-related protein  100 
 
 
610 aa  1258    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0995937  hitchhiker  0.00000000519936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4242  UbiD family decarboxylase  55.25 
 
 
609 aa  676    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3015  Carboxylyase-related protein  51.14 
 
 
610 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2237  carboxylyase-like protein  53.75 
 
 
620 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1842  UbiD family decarboxylase  55.03 
 
 
613 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1323  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase family protein  50.57 
 
 
649 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.567448  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3173  Carboxylyase-related protein  50.08 
 
 
624 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.546258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0260  Carboxylyase-related protein  51.87 
 
 
615 aa  616  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0751  Carboxylyase-related protein  49.52 
 
 
621 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0168  UbiD family decarboxylase  36.07 
 
 
589 aa  359  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0201007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0962  UbiD family decarboxylase  34.7 
 
 
585 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00051781  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_002620  TC0359  hypothetical protein  36.05 
 
 
579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2197  UbiD family decarboxylase  31.56 
 
 
481 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1452  UbiD family decarboxylase  31.26 
 
 
479 aa  210  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.191341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3368  UbiD family decarboxylase  32.56 
 
 
639 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338495  normal  0.193893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4203  UbiD family decarboxylase  38.97 
 
 
509 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0375  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  32.23 
 
 
517 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.466573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0677  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.41 
 
 
482 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.809933  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0008  UbiD family decarboxylase  30.93 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3212  UbiD family decarboxylase  27.39 
 
 
594 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14820  UbiD family decarboxylase  30.74 
 
 
481 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0356  UbiD family decarboxylase  28.91 
 
 
606 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.99218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0482  UbiD family decarboxylase  30.87 
 
 
495 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.283568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0008  UbiD family decarboxylase  30.4 
 
 
487 aa  194  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0287  UbiD family decarboxylase  27.96 
 
 
617 aa  194  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0404  UbiD family decarboxylase  32.23 
 
 
504 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.505316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0292  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.92 
 
 
504 aa  192  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0585  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.31 
 
 
522 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.168345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0403  UbiD family decarboxylase  31.61 
 
 
504 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0730  UbiD family decarboxylase  29.54 
 
 
606 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0520  UbiD family decarboxylase  29.92 
 
 
493 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0556  UbiD family decarboxylase  31.12 
 
 
491 aa  190  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0555  UbiD family decarboxylase  29.02 
 
 
480 aa  189  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.431346 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0268  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  30.49 
 
 
504 aa  187  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.974118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0211  carboxylyase-like protein  29.88 
 
 
487 aa  187  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.995594  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3118  UbiD family decarboxylase  30.57 
 
 
504 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0242  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.46 
 
 
618 aa  187  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2531  UbiD family decarboxylase  29.14 
 
 
488 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.853758 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3188  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.81 
 
 
489 aa  186  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  hitchhiker  0.00754697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0095  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  30 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.218951  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0515  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  31.79 
 
 
507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0822  UbiD family decarboxylase  31.37 
 
 
485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3657  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.42 
 
 
490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670347  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2240  carboxylyase-like protein  29.86 
 
 
621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00980247  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6115  UbiD family decarboxylase  31.21 
 
 
504 aa  184  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612596  normal  0.345473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5213  UbiD family decarboxylase  29.85 
 
 
550 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354632  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5274  UbiD family decarboxylase  29.96 
 
 
488 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5122  UbiD family decarboxylase  29.75 
 
 
488 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5036  UbiD family decarboxylase  29.75 
 
 
488 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4328  carboxylyase-like protein  29.08 
 
 
512 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0255  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.51 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.278215  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03475  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxylyase  29.21 
 
 
488 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2610  carboxylyase-like protein  28.97 
 
 
487 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.68 
 
 
506 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.13548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4209  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.89 
 
 
492 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4305  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.89 
 
 
492 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1270  UbiD family decarboxylase  31.69 
 
 
482 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4186  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.89 
 
 
492 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0856044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4258  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.89 
 
 
492 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.772564  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0474  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.64 
 
 
491 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3709  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.97 
 
 
502 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536812  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0864  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  27.37 
 
 
605 aa  177  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.04366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3754  UbiD family decarboxylase  29.32 
 
 
498 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3906  UbiD family decarboxylase  29.65 
 
 
498 aa  177  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4365  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.89 
 
 
492 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3632  UbiD family decarboxylase  28.82 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1909  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.75 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3936  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.54 
 
 
506 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2481  UbiD family decarboxylase  28.82 
 
 
502 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5241  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  29.42 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0280  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.54 
 
 
498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2251  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.84 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202201 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4065  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.54 
 
 
497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3952  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.75 
 
 
501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4094  UbiD family decarboxylase  30.89 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.576442  normal  0.345928 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002100  3-polyprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase  26.81 
 
 
617 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00373148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69150  hypothetical protein  29.81 
 
 
488 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2282  UbiD family decarboxylase  27.62 
 
 
488 aa  174  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4047  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  28.96 
 
 
498 aa  174  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03734  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.32 
 
 
497 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2525  UbiD family decarboxylase  28.19 
 
 
504 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03683  hypothetical protein  29.32 
 
 
497 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0302  carboxylyase-like protein  29.21 
 
 
492 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4313  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.47 
 
 
497 aa  174  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5980  hypothetical protein  29.5 
 
 
488 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0574  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.45 
 
 
507 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4138  UbiD family decarboxylase  29.32 
 
 
497 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4167  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.32 
 
 
497 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1325  carboxylyase-like protein  28.88 
 
 
520 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4781  carboxylyase-like protein  35.94 
 
 
508 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4362  3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase  29.32 
 
 
497 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.452343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5454  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  29.54 
 
 
488 aa  173  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2588  3-octaprenyl-4hydroxybenzoate decarboxylase  28.95 
 
 
506 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.884779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>