219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0288 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 345 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  44.9 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  65.12 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  27.34 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  27.93 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.96 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  25.73 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  24.85 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  46.58 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  33.59 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  25 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  24.74 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  24.74 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  26.14 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  25.89 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  27.81 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  30.15 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  43.24 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.21 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 260 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  50.82 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  45.45 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  40.24 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  37.27 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  47.83 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  26.49 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  33.54 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  45.45 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2542  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150986  hitchhiker  0.00310963 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  35.53 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  29.92 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  29.92 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  23.26 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  25.68 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  47.54 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  31.07 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  47.54 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  47.54 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  32.48 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  47.54 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  47.54 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  42.86 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  31.14 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  44.29 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  27.1 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  47.54 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  47.54 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  25.51 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  32.81 
 
 		 510 aa  62.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3643  heat shock protein DnaJ domain protein  44.93 
 
 		 511 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129594  normal  0.0124484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  32.28 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  35.34 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  30.06 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  42.86 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  41.56 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  33.14 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  22.87 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  37.68 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6266  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1751  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1724  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305446  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1813  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  29.5 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  26.69 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  39.24 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  27.88 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  35.9 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  26.48 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  34.35 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  33.33 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  45.31 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  25.3 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5114  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.48 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  34.69 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>